More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2971 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  55.82 
 
 		 639 aa  646    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  55.68 
 
 		 655 aa  660    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  55.9 
 
 		 648 aa  701    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  100 
 
 		 619 aa  1240    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  100 
 
 		 619 aa  1240    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  55.81 
 
 		 650 aa  691    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  51.29 
 
 		 652 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  51.05 
 
 		 670 aa  608  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  43.52 
 
 		 558 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  43.8 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  44.04 
 
 		 575 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  46.27 
 
 		 570 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  44.72 
 
 		 558 aa  405  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  46.06 
 
 		 570 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  42.69 
 
 		 566 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  43.22 
 
 		 572 aa  389  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  43.45 
 
 		 560 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  42.88 
 
 		 557 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  41.76 
 
 		 537 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.31 
 
 		 563 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  41.35 
 
 		 558 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  43.28 
 
 		 579 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  43.45 
 
 		 557 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  42.94 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  42.94 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  42.94 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  42.94 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  42.94 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  43.85 
 
 		 556 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  42.94 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  42.94 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  42.54 
 
 		 556 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  42.74 
 
 		 556 aa  369  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  42.94 
 
 		 557 aa  369  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  41.75 
 
 		 556 aa  363  4e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  30.31 
 
 		 680 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1899  ATP-dependent protease La  28.22 
 
 		 874 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67239  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1659  Lon-A peptidase  28.42 
 
 		 875 aa  125  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.241054  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  27.96 
 
 		 731 aa  125  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  27.64 
 
 		 785 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  27.22 
 
 		 785 aa  124  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  33.67 
 
 		 882 aa  124  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  27.64 
 
 		 785 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  27.72 
 
 		 784 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.72 
 
 		 784 aa  124  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  27.72 
 
 		 785 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  27.72 
 
 		 785 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  27.43 
 
 		 785 aa  123  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  27.72 
 
 		 785 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.08 
 
 		 784 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  28.08 
 
 		 784 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.35 
 
 		 787 aa  123  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.08 
 
 		 784 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.08 
 
 		 784 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.08 
 
 		 784 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  28.08 
 
 		 784 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.08 
 
 		 784 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.08 
 
 		 799 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  30.09 
 
 		 645 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.08 
 
 		 784 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  28.91 
 
 		 765 aa  122  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  28.54 
 
 		 693 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  27.48 
 
 		 785 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.55 
 
 		 786 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.71 
 
 		 793 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 783 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  29.4 
 
 		 698 aa  120  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  28.27 
 
 		 711 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  27.34 
 
 		 638 aa  120  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  26.75 
 
 		 821 aa  120  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  27.31 
 
 		 785 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  27.9 
 
 		 778 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  27.03 
 
 		 810 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  27.16 
 
 		 788 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  26.25 
 
 		 793 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  26.97 
 
 		 631 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  26.61 
 
 		 785 aa  118  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  27.85 
 
 		 803 aa  118  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.68 
 
 		 784 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.68 
 
 		 784 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.68 
 
 		 784 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.68 
 
 		 784 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  28.51 
 
 		 806 aa  117  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.68 
 
 		 784 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  26.79 
 
 		 785 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  28.79 
 
 		 662 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  26.87 
 
 		 781 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  28.47 
 
 		 635 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  26.19 
 
 		 810 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  28.12 
 
 		 817 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  27.36 
 
 		 786 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  28.23 
 
 		 805 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  29.31 
 
 		 756 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.52 
 
 		 784 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  39.34 
 
 		 785 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.52 
 
 		 784 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  27.52 
 
 		 784 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  27.03 
 
 		 637 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  29.31 
 
 		 787 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  27.35 
 
 		 802 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>