More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0866 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  67.55 
 
 		 558 aa  718    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  75 
 
 		 556 aa  835    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  75 
 
 		 557 aa  832    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  75 
 
 		 557 aa  834    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  75 
 
 		 557 aa  834    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  61.83 
 
 		 560 aa  675    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  75 
 
 		 557 aa  834    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  64.53 
 
 		 563 aa  690    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  65.47 
 
 		 557 aa  701    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  100 
 
 		 557 aa  1125    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  64.86 
 
 		 558 aa  672    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  67.42 
 
 		 558 aa  733    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  68.06 
 
 		 575 aa  741    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  75 
 
 		 557 aa  834    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  64.25 
 
 		 579 aa  712    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  75.19 
 
 		 556 aa  835    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  63.57 
 
 		 572 aa  679    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  75.37 
 
 		 556 aa  836    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  63.33 
 
 		 537 aa  699    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  69.98 
 
 		 571 aa  746    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  75 
 
 		 557 aa  832    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  75 
 
 		 557 aa  834    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  87.61 
 
 		 556 aa  973    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  59.3 
 
 		 570 aa  651    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  59.67 
 
 		 570 aa  653    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  58.23 
 
 		 566 aa  657    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  73.52 
 
 		 556 aa  822    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  46.23 
 
 		 648 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  43.61 
 
 		 650 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  44.14 
 
 		 639 aa  405  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  44.14 
 
 		 652 aa  395  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  41.9 
 
 		 670 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  46.85 
 
 		 655 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  44.58 
 
 		 619 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  44.58 
 
 		 619 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  31.33 
 
 		 698 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  29.76 
 
 		 731 aa  140  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  30.43 
 
 		 637 aa  134  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  29.98 
 
 		 631 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  30.02 
 
 		 765 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  28.4 
 
 		 778 aa  131  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  29.12 
 
 		 645 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  28.89 
 
 		 817 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  29.17 
 
 		 632 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  29.58 
 
 		 638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  29.98 
 
 		 793 aa  127  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  30.38 
 
 		 807 aa  126  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  27.89 
 
 		 807 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  31.15 
 
 		 680 aa  125  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  29.42 
 
 		 812 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  31.73 
 
 		 635 aa  124  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  28.94 
 
 		 808 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  28.29 
 
 		 815 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  28.64 
 
 		 711 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  28.54 
 
 		 815 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  31.62 
 
 		 797 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  29.81 
 
 		 662 aa  122  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  27.8 
 
 		 693 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  29.67 
 
 		 811 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  28.97 
 
 		 774 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  29.52 
 
 		 804 aa  120  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  28.16 
 
 		 806 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  28.72 
 
 		 793 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  30.21 
 
 		 805 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  28.55 
 
 		 806 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  30.04 
 
 		 805 aa  118  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  29.1 
 
 		 768 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 808 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  29.25 
 
 		 775 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  29.34 
 
 		 815 aa  116  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  29.57 
 
 		 812 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  28.38 
 
 		 823 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  29.51 
 
 		 812 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  40.87 
 
 		 806 aa  115  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  34.13 
 
 		 804 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  43.98 
 
 		 805 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  28.48 
 
 		 804 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  29.51 
 
 		 810 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  28.95 
 
 		 807 aa  114  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 797 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 812 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  28.19 
 
 		 817 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  40.4 
 
 		 806 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  37.44 
 
 		 800 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  40.4 
 
 		 806 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  27.93 
 
 		 813 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  28.75 
 
 		 811 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  30.27 
 
 		 867 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  43.46 
 
 		 805 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  28.81 
 
 		 796 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  27.39 
 
 		 801 aa  112  3e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  27.93 
 
 		 810 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  29.05 
 
 		 784 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  26.65 
 
 		 809 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3467  ATP-dependent protease La  27.55 
 
 		 798 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.895403  hitchhiker  0.000510926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  27.55 
 
 		 798 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1744  ATP-dependent protease La  27.35 
 
 		 798 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484284  hitchhiker  0.00114156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  28.48 
 
 		 808 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1904  ATP-dependent protease La  27.55 
 
 		 798 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798335  hitchhiker  0.000618765 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  28.03 
 
 		 807 aa  110  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>