More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0276 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  60.77 
 
 
778 aa  760    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  100 
 
 
645 aa  1312    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  61.12 
 
 
731 aa  784    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  66.13 
 
 
698 aa  845    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  60.5 
 
 
631 aa  734    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  78.66 
 
 
638 aa  1020    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  75.91 
 
 
680 aa  948    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  73.66 
 
 
632 aa  951    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  67.59 
 
 
637 aa  860    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  62.28 
 
 
711 aa  805    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  64.6 
 
 
693 aa  786    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  79.54 
 
 
662 aa  993    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  66.78 
 
 
635 aa  852    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  64.64 
 
 
765 aa  796    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1394  AAA ATPase central domain protein  49.36 
 
 
496 aa  220  5e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0502  peptidase S16, Lon-like protease  32.96 
 
 
685 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.85369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0433  peptidase S16, Lon-like protease  33.94 
 
 
692 aa  208  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.317598  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1487  peptidase S16, Lon-like protease  33.94 
 
 
693 aa  207  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0404  Lon-B peptidase  33.07 
 
 
692 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.175581  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1350  peptidase S16, Lon-like protease  33.33 
 
 
703 aa  200  6e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.966121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  30.53 
 
 
575 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  31.05 
 
 
558 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  32.5 
 
 
571 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  30.32 
 
 
648 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  29.31 
 
 
639 aa  144  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  29.18 
 
 
558 aa  142  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.75 
 
 
563 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  29.03 
 
 
579 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  31.82 
 
 
558 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  26.07 
 
 
660 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.31 
 
 
794 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.54 
 
 
794 aa  139  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.91 
 
 
807 aa  138  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  29.02 
 
 
652 aa  135  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  27.6 
 
 
670 aa  133  7.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  29.52 
 
 
570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  29.75 
 
 
570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.31 
 
 
802 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  40.69 
 
 
819 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  28.45 
 
 
537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  28.66 
 
 
566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  24.41 
 
 
810 aa  128  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  30.43 
 
 
556 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  41.21 
 
 
812 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  26.84 
 
 
786 aa  127  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  40.7 
 
 
812 aa  127  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  28.91 
 
 
560 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  26.4 
 
 
819 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  27.69 
 
 
831 aa  126  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  26.55 
 
 
823 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  26.62 
 
 
819 aa  125  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  26.75 
 
 
786 aa  125  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  32.56 
 
 
810 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  26.27 
 
 
810 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.54 
 
 
816 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  23.49 
 
 
807 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  24.67 
 
 
790 aa  123  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  27.92 
 
 
803 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  27.43 
 
 
817 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0802  peptidase S16, lon-like protein  23.82 
 
 
801 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.85 
 
 
783 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  30.15 
 
 
572 aa  121  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  24.48 
 
 
806 aa  120  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  24.77 
 
 
787 aa  120  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.74 
 
 
788 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.56 
 
 
810 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1297  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.23 
 
 
786 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000625582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  24.84 
 
 
795 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  25.27 
 
 
802 aa  118  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  30.04 
 
 
557 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.83 
 
 
843 aa  118  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  29.68 
 
 
556 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  29.69 
 
 
619 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  29.69 
 
 
619 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  24.27 
 
 
805 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  24.27 
 
 
805 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.36 
 
 
805 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  24.05 
 
 
777 aa  117  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  24.53 
 
 
791 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  28.67 
 
 
814 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.96 
 
 
805 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  26.34 
 
 
821 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  29.83 
 
 
557 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  27.08 
 
 
803 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  29.25 
 
 
556 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  33.47 
 
 
811 aa  115  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  29.61 
 
 
557 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  29.61 
 
 
557 aa  114  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  29.61 
 
 
557 aa  114  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  29.61 
 
 
557 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  29.61 
 
 
556 aa  114  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  29.61 
 
 
557 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  27.8 
 
 
844 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.67 
 
 
805 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  25.44 
 
 
800 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000551631  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.67 
 
 
805 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  25.67 
 
 
805 aa  113  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  38.8 
 
 
802 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  37.11 
 
 
810 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  25.25 
 
 
786 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>