More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1843 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  62.95 
 
 
537 aa  719    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4562  ATP-dependent protease LA  64.35 
 
 
557 aa  693    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4316  sporulation protease LonB  64.35 
 
 
556 aa  694    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  64.78 
 
 
558 aa  724    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4589  ATP-dependent protease LonB  64.35 
 
 
556 aa  693    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0914103  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4368  ATP-dependent protease LA  64.54 
 
 
557 aa  695    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4204  ATP-dependent protease LA  64.54 
 
 
557 aa  695    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4215  ATP-dependent protease LA  64.54 
 
 
557 aa  695    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  66.17 
 
 
571 aa  759    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  65.35 
 
 
575 aa  738    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4558  ATP-dependent protease LonB  64.54 
 
 
557 aa  695    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0645  ATP-dependent protease LonB  64.54 
 
 
556 aa  696    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.79824  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3185  sporulation protease LonB  63.79 
 
 
556 aa  690    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4703  ATP-dependent protease LA  64.54 
 
 
557 aa  695    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0530  AAA ATPase  65.41 
 
 
572 aa  683    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0252109  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1843  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 
558 aa  1125    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.331882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  65.5 
 
 
558 aa  703    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0812  Sigma 54 interacting domain protein  63.28 
 
 
560 aa  699    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4607  ATP-dependent protease LonB  64.35 
 
 
557 aa  693    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  58.35 
 
 
570 aa  651    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  58.35 
 
 
570 aa  649    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1477  peptidase S16, lon domain-containing protein  64.62 
 
 
563 aa  712    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.448657  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  59.09 
 
 
566 aa  665    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2586  ATP-dependent protease LonB  64.58 
 
 
556 aa  698    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000324965  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0492  Sigma 54 interacting domain protein  64.85 
 
 
557 aa  692    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.335445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0866  ATP-dependent protease LonB  67.55 
 
 
557 aa  716    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  67.17 
 
 
579 aa  743    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  44.27 
 
 
639 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  45.54 
 
 
648 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  44.82 
 
 
650 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  44.71 
 
 
652 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  42.01 
 
 
670 aa  386  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  43.42 
 
 
619 aa  379  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  43.42 
 
 
619 aa  379  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  44.58 
 
 
655 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  31.82 
 
 
631 aa  162  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0276  ATP-dependent protease Lon  31.82 
 
 
645 aa  154  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000589663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0976  ATP-dependent protease Lon  32.15 
 
 
680 aa  148  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.01926  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3532  ATP-dependent protease Lon  32.6 
 
 
698 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2694  ATP-dependent protease Lon  30.75 
 
 
638 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  31.22 
 
 
637 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2822  Sigma 54 interacting domain protein  29.66 
 
 
778 aa  140  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0860  Sigma 54 interacting domain protein  29.78 
 
 
731 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0776  ATP-dependent protease Lon  29.72 
 
 
632 aa  136  9e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000293467  unclonable  0.000000000000496506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  28.92 
 
 
662 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1038  ATP-dependent protease Lon  30.44 
 
 
765 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2897  ATP-dependent protease Lon  28.79 
 
 
711 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.512346  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  30.62 
 
 
635 aa  131  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3199  ATP-dependent protease Lon  29.56 
 
 
693 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  28.98 
 
 
817 aa  121  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  29.25 
 
 
815 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  28.4 
 
 
823 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  27.44 
 
 
817 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0427  ATP-dependent protease La  25.83 
 
 
820 aa  110  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.272294  normal  0.22143 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  28.71 
 
 
811 aa  110  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  28.71 
 
 
816 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  28.08 
 
 
823 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  25.71 
 
 
787 aa  106  1e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  28.03 
 
 
802 aa  104  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  40.31 
 
 
793 aa  103  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 
807 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  29.26 
 
 
774 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  28.12 
 
 
835 aa  102  1e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  37.56 
 
 
819 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  27.2 
 
 
817 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  27.55 
 
 
816 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  39.11 
 
 
793 aa  101  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  33.88 
 
 
807 aa  101  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  38 
 
 
812 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  38.94 
 
 
813 aa  100  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  37.56 
 
 
815 aa  100  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  39.02 
 
 
793 aa  100  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0407  ATP-dependent protease La  27.12 
 
 
810 aa  100  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  29.73 
 
 
793 aa  100  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  28.69 
 
 
797 aa  99.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 
810 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  27.57 
 
 
798 aa  99.8  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 
812 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  37.09 
 
 
785 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1725  ATP-dependent protease La  36 
 
 
814 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000125978  decreased coverage  0.00323118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  27.75 
 
 
812 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  28.46 
 
 
806 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  37.09 
 
 
785 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  37.09 
 
 
785 aa  98.6  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  37.09 
 
 
784 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.08 
 
 
784 aa  99  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  26.35 
 
 
785 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  27.29 
 
 
825 aa  98.6  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  37.06 
 
 
823 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0485  ATP-dependent protease La  25.1 
 
 
830 aa  98.6  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0185488  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  27.04 
 
 
797 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  37.25 
 
 
783 aa  98.2  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  28.48 
 
 
792 aa  97.8  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  26.88 
 
 
798 aa  98.2  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  28.86 
 
 
806 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  28.15 
 
 
805 aa  97.8  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  36.28 
 
 
806 aa  97.8  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.46 
 
 
786 aa  97.8  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  37.69 
 
 
786 aa  97.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  37.5 
 
 
781 aa  97.4  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>