More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2559 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  45.08 
 
 		 840 aa  635    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  46.54 
 
 		 773 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  46.94 
 
 		 776 aa  659    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  46.68 
 
 		 776 aa  655    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  46.54 
 
 		 776 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  46.68 
 
 		 776 aa  655    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  73.77 
 
 		 802 aa  1201    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  46.55 
 
 		 797 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  71.19 
 
 		 793 aa  1149    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  46.87 
 
 		 775 aa  649    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  46.94 
 
 		 773 aa  659    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  46.68 
 
 		 776 aa  655    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  47.33 
 
 		 776 aa  659    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  63.35 
 
 		 797 aa  1010    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 794 aa  1607    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  46.03 
 
 		 797 aa  646    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  44.29 
 
 		 810 aa  636    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  45.94 
 
 		 773 aa  642    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  47.2 
 
 		 776 aa  659    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  46.81 
 
 		 812 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  76.04 
 
 		 794 aa  1217    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  47.07 
 
 		 773 aa  654    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  47.26 
 
 		 774 aa  656    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  46.49 
 
 		 835 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  46.36 
 
 		 835 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  45.45 
 
 		 815 aa  632  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  46.23 
 
 		 843 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  44.85 
 
 		 816 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  45.84 
 
 		 828 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  45.01 
 
 		 778 aa  629  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  44.66 
 
 		 817 aa  628  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  44.33 
 
 		 775 aa  626  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  44.47 
 
 		 768 aa  628  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  44.83 
 
 		 801 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1146  ATP-dependent protease La  53.58 
 
 		 801 aa  623  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  45.15 
 
 		 792 aa  622  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  44.4 
 
 		 804 aa  617  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  44.42 
 
 		 804 aa  615  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  45.41 
 
 		 806 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  43.81 
 
 		 811 aa  616  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  45.15 
 
 		 806 aa  615  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  44.29 
 
 		 817 aa  615  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  43.99 
 
 		 819 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  44.65 
 
 		 805 aa  615  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  44.13 
 
 		 783 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  46.12 
 
 		 810 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  44.21 
 
 		 785 aa  615  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  43.8 
 
 		 785 aa  609  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  42.91 
 
 		 782 aa  608  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  43.26 
 
 		 785 aa  609  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  42.66 
 
 		 846 aa  611  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  43.38 
 
 		 786 aa  611  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  43.69 
 
 		 785 aa  609  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  43.25 
 
 		 806 aa  610  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.56 
 
 		 786 aa  611  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  43.68 
 
 		 823 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  44.88 
 
 		 797 aa  610  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  44.03 
 
 		 805 aa  611  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  44.02 
 
 		 783 aa  612  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  43.26 
 
 		 785 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  43.26 
 
 		 785 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.44 
 
 		 787 aa  611  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  43.52 
 
 		 785 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  43.41 
 
 		 785 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  44.9 
 
 		 802 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  43.22 
 
 		 798 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  43.41 
 
 		 785 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.31 
 
 		 793 aa  608  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  42.8 
 
 		 785 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  43.53 
 
 		 788 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  44.77 
 
 		 804 aa  605  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.44 
 
 		 793 aa  608  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  44.26 
 
 		 785 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  42.78 
 
 		 781 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  44.13 
 
 		 806 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.46 
 
 		 784 aa  604  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  43.3 
 
 		 784 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  44.6 
 
 		 806 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.93 
 
 		 784 aa  604  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  43.55 
 
 		 779 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  43.98 
 
 		 805 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  42.89 
 
 		 783 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.06 
 
 		 784 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  43.81 
 
 		 805 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  43.85 
 
 		 803 aa  604  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.93 
 
 		 784 aa  604  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.93 
 
 		 784 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  44.62 
 
 		 818 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  44.13 
 
 		 806 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  43.17 
 
 		 785 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  42.8 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.93 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.93 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.8 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.78 
 
 		 784 aa  599  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.93 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.8 
 
 		 784 aa  601  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.93 
 
 		 784 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  43.46 
 
 		 867 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  43.97 
 
 		 783 aa  600  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>