More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3051 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  70.04 
 
 
821 aa  1183    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  44.02 
 
 
873 aa  691    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.97 
 
 
801 aa  652    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  42 
 
 
832 aa  635    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  41.57 
 
 
844 aa  651    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1607  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.81 
 
 
815 aa  648    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  45.19 
 
 
817 aa  706    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  46 
 
 
798 aa  745    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  43.78 
 
 
787 aa  698    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.39 
 
 
806 aa  709    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1297  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.04 
 
 
786 aa  760    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000625582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.56 
 
 
807 aa  710    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  51.85 
 
 
803 aa  872    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  44.14 
 
 
799 aa  672    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  67.67 
 
 
811 aa  1163    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000135674  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.24 
 
 
843 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2007  ATP-dependent protease, putative  41.41 
 
 
829 aa  658    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.303021  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.88 
 
 
865 aa  712    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  42.96 
 
 
861 aa  679    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  45.05 
 
 
814 aa  755    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  44.44 
 
 
811 aa  713    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  65.23 
 
 
819 aa  1107    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  44.13 
 
 
809 aa  705    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  42.41 
 
 
808 aa  681    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  46 
 
 
803 aa  722    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  44.28 
 
 
831 aa  720    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  41.85 
 
 
806 aa  654    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 
825 aa  1704    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  48.28 
 
 
818 aa  780    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  42.1 
 
 
813 aa  665    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.05 
 
 
813 aa  643    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  44.49 
 
 
815 aa  712    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  70.06 
 
 
805 aa  1192    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0802  peptidase S16, lon-like protein  44.14 
 
 
801 aa  734    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  41.37 
 
 
786 aa  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  43.12 
 
 
810 aa  722    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  45.02 
 
 
823 aa  735    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  42.46 
 
 
803 aa  669    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  65.61 
 
 
819 aa  1115    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  60.56 
 
 
805 aa  1006    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3069  ATP-dependent protease, putative  74.72 
 
 
813 aa  1269    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.98 
 
 
794 aa  627  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.11 
 
 
794 aa  627  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  41.39 
 
 
809 aa  615  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.45 
 
 
788 aa  617  1e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.73 
 
 
802 aa  597  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  39.82 
 
 
814 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  39.8 
 
 
819 aa  582  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1447  ATP-dependent protease, putative  39.64 
 
 
806 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  37.64 
 
 
786 aa  566  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.68 
 
 
805 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.68 
 
 
805 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  38.68 
 
 
805 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.31 
 
 
805 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  37.86 
 
 
786 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.64 
 
 
810 aa  561  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  36.95 
 
 
817 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  38.24 
 
 
805 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.11 
 
 
805 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  36.61 
 
 
817 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  37.98 
 
 
805 aa  553  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  38.06 
 
 
786 aa  554  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  36.18 
 
 
812 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  36.28 
 
 
811 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  36.14 
 
 
829 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000280038  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  36.39 
 
 
806 aa  545  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  37.56 
 
 
806 aa  542  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  37.45 
 
 
800 aa  542  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000551631  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0590  ATP-dependent protease, putative  37.17 
 
 
811 aa  545  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0118699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.76 
 
 
816 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  36.68 
 
 
812 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.49 
 
 
783 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  36.03 
 
 
811 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  36.68 
 
 
812 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.67 
 
 
806 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347497  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  36.88 
 
 
795 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  35.87 
 
 
827 aa  539  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  36.01 
 
 
812 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.42 
 
 
812 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  38.7 
 
 
791 aa  538  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0676  putative ATP-dependent protease LA, putative  38.31 
 
 
810 aa  535  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  37.43 
 
 
810 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  36.39 
 
 
807 aa  534  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3315  putative ATP-dependent protease La, putative  38.2 
 
 
806 aa  524  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2626  ATP-dependent protease, putative  36.47 
 
 
803 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000239913  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2798  peptidase S16 lon domain protein  36.12 
 
 
811 aa  510  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00224654  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  36.08 
 
 
777 aa  511  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1037  peptidase S16 lon domain protein  35.88 
 
 
774 aa  506  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.350098  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1288  peptidase S16 lon domain protein  36.27 
 
 
811 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  33.81 
 
 
795 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  33.73 
 
 
798 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2600  ATP-dependent protease, putative  34.85 
 
 
784 aa  487  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  32.91 
 
 
802 aa  477  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2053  putative ATP-dependent protease La, putative  39.22 
 
 
817 aa  477  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0284052  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.9 
 
 
790 aa  468  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1322  hypothetical protein  31.89 
 
 
951 aa  458  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1056  peptidase S16, lon-like  31.76 
 
 
975 aa  455  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  46.77 
 
 
660 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0955  ATP-dependent protease, putative  32.53 
 
 
797 aa  406  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.099615  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1399  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.42 
 
 
810 aa  345  1e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000669789  hitchhiker  0.00375305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>