More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0350 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0350  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 		 722 aa  1427    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0805  peptidase S16 lon domain protein  52.43 
 
 		 726 aa  672    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.664737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  33.84 
 
 		 818 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.19 
 
 		 788 aa  352  2e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  30.22 
 
 		 810 aa  336  7.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  32.2 
 
 		 817 aa  333  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.64 
 
 		 801 aa  331  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  32.66 
 
 		 806 aa  331  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.51 
 
 		 802 aa  330  5.0000000000000004e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.99 
 
 		 813 aa  329  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  33.2 
 
 		 813 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.88 
 
 		 865 aa  328  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  30.1 
 
 		 827 aa  327  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  31.12 
 
 		 812 aa  327  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  31.12 
 
 		 812 aa  327  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  30.22 
 
 		 817 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.98 
 
 		 812 aa  326  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.71 
 
 		 807 aa  326  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  29.99 
 
 		 810 aa  326  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  30.22 
 
 		 817 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  31.03 
 
 		 829 aa  325  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000280038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  32.13 
 
 		 812 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  32.32 
 
 		 812 aa  324  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.81 
 
 		 805 aa  325  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.17 
 
 		 805 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  29.51 
 
 		 814 aa  323  7e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.04 
 
 		 805 aa  323  7e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.63 
 
 		 805 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  31.04 
 
 		 805 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.05 
 
 		 810 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  31.01 
 
 		 798 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.93 
 
 		 783 aa  320  5e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  31.76 
 
 		 811 aa  320  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  30.77 
 
 		 798 aa  320  7.999999999999999e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  32.87 
 
 		 803 aa  319  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  32.56 
 
 		 795 aa  319  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  30.93 
 
 		 803 aa  318  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2007  ATP-dependent protease, putative  30.12 
 
 		 829 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.303021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.44 
 
 		 805 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.29 
 
 		 794 aa  316  8e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  31.48 
 
 		 811 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  29.95 
 
 		 805 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  32.09 
 
 		 831 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000165888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  29.67 
 
 		 806 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  29.23 
 
 		 807 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.95 
 
 		 805 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  31.76 
 
 		 786 aa  314  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.29 
 
 		 794 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  29.81 
 
 		 805 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  30.6 
 
 		 815 aa  313  6.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1297  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.35 
 
 		 786 aa  312  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000625582  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  29.42 
 
 		 786 aa  312  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  31.34 
 
 		 802 aa  311  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  27.43 
 
 		 787 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  29.58 
 
 		 825 aa  311  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  29.97 
 
 		 806 aa  310  4e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  28.65 
 
 		 821 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3069  ATP-dependent protease, putative  29.81 
 
 		 813 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  32.28 
 
 		 844 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  31.16 
 
 		 819 aa  308  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.09 
 
 		 806 aa  306  9.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  29.1 
 
 		 811 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000135674  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  29.53 
 
 		 786 aa  306  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  28.42 
 
 		 786 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  31.71 
 
 		 799 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  28.9 
 
 		 800 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000551631  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  37.82 
 
 		 660 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.01 
 
 		 816 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  30.75 
 
 		 819 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0802  peptidase S16, lon-like protein  26.92 
 
 		 801 aa  302  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  29.24 
 
 		 777 aa  301  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  29.51 
 
 		 795 aa  301  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  31.93 
 
 		 832 aa  300  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2600  ATP-dependent protease, putative  32.35 
 
 		 784 aa  300  9e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1288  peptidase S16 lon domain protein  32.46 
 
 		 811 aa  299  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  32.27 
 
 		 809 aa  299  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1322  hypothetical protein  29.79 
 
 		 951 aa  298  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.79 
 
 		 790 aa  298  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  34 
 
 		 814 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2798  peptidase S16 lon domain protein  30.71 
 
 		 811 aa  295  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00224654  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  29.97 
 
 		 791 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  30.45 
 
 		 803 aa  293  9e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  28.23 
 
 		 823 aa  293  9e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  29.85 
 
 		 809 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.73 
 
 		 806 aa  291  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  30.59 
 
 		 861 aa  289  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  27.99 
 
 		 873 aa  289  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  29.5 
 
 		 811 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0590  ATP-dependent protease, putative  30.78 
 
 		 811 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0118699 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1056  peptidase S16, lon-like  32.96 
 
 		 975 aa  283  7.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  29.51 
 
 		 808 aa  283  7.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1607  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.28 
 
 		 815 aa  281  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1037  peptidase S16 lon domain protein  27.03 
 
 		 774 aa  279  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.350098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  40.09 
 
 		 819 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1399  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.76 
 
 		 810 aa  276  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000669789  hitchhiker  0.00375305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.13 
 
 		 843 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0955  ATP-dependent protease, putative  29.48 
 
 		 797 aa  273  9e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.099615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2023  ATP-dependent protease  27.12 
 
 		 761 aa  269  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2626  ATP-dependent protease, putative  29.69 
 
 		 803 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000239913  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1447  ATP-dependent protease, putative  40.92 
 
 		 806 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>