89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1590 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  100 
 
 
363 aa  729    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  51.79 
 
 
364 aa  364  1e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  53.94 
 
 
350 aa  347  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  43.2 
 
 
343 aa  263  4.999999999999999e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  39.14 
 
 
358 aa  230  4e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  38.46 
 
 
357 aa  228  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  38.7 
 
 
336 aa  224  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.65 
 
 
338 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  33.81 
 
 
347 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  33.81 
 
 
345 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  33.81 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  33.52 
 
 
340 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  33.52 
 
 
340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  33.52 
 
 
340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  33.24 
 
 
340 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  33.24 
 
 
340 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  33.24 
 
 
340 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.95 
 
 
341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.95 
 
 
341 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.89 
 
 
339 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.38 
 
 
337 aa  132  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  29.49 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.12 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  27.41 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  26.01 
 
 
316 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  31.84 
 
 
381 aa  106  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  34.01 
 
 
342 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  34.01 
 
 
345 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  34.01 
 
 
342 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  25.48 
 
 
337 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.59 
 
 
348 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  27.04 
 
 
345 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  25.4 
 
 
348 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  28.47 
 
 
374 aa  93.6  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  25.64 
 
 
383 aa  93.2  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.93 
 
 
356 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  29.97 
 
 
342 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  29.6 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  28.62 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.24 
 
 
353 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  27.3 
 
 
395 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  31.73 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.32 
 
 
394 aa  87.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  24.26 
 
 
357 aa  86.3  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.92 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  33.9 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.21 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  23.89 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.6 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  32.91 
 
 
338 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.7 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  26.57 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  26.92 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  31.25 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  25.61 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  28.65 
 
 
358 aa  72  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  24.49 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  36.07 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  46.58 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  29.1 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.73 
 
 
628 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  32.41 
 
 
810 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  27.73 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  29.6 
 
 
801 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  39.68 
 
 
442 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  30.28 
 
 
837 aa  47.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  38.46 
 
 
794 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  27.67 
 
 
812 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.68 
 
 
442 aa  47  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  38.46 
 
 
794 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  29.63 
 
 
783 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  29.63 
 
 
786 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  34.72 
 
 
632 aa  46.2  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  32.04 
 
 
772 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  29.47 
 
 
511 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
796 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  40 
 
 
652 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  32.56 
 
 
489 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  29.41 
 
 
816 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  38.1 
 
 
854 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  32.41 
 
 
813 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  34.92 
 
 
756 aa  43.9  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  34.92 
 
 
787 aa  44.3  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  28.45 
 
 
799 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  29.25 
 
 
462 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  30.65 
 
 
816 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  28.33 
 
 
835 aa  43.1  0.008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  30.97 
 
 
772 aa  43.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  36.67 
 
 
395 aa  42.7  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>