More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1787 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 
628 aa  1247    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0532  hypothetical protein  31.95 
 
 
614 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.26777  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1597  hypothetical protein  34.32 
 
 
614 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000203225  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0384  hypothetical protein  32.31 
 
 
606 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0784776  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0315  hypothetical protein  33.05 
 
 
614 aa  134  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.463593 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  34.45 
 
 
632 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0963  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.29 
 
 
640 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  33.02 
 
 
309 aa  98.6  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1658  ATP-dependent protease La  34.24 
 
 
307 aa  87.4  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0873  peptidase S16 lon domain-containing protein  24.63 
 
 
550 aa  82.8  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1960  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.78 
 
 
557 aa  81.6  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  38.89 
 
 
558 aa  77  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  35.88 
 
 
786 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  35.11 
 
 
783 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1954  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.75 
 
 
289 aa  76.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  37.09 
 
 
806 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  37.09 
 
 
806 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  35.53 
 
 
796 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  36.11 
 
 
792 aa  73.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  45.98 
 
 
558 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  35.53 
 
 
811 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0794  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.67 
 
 
553 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000691143 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  35.1 
 
 
787 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  35.76 
 
 
808 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  33.58 
 
 
537 aa  72.8  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  38.06 
 
 
652 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  35.1 
 
 
756 aa  72  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 
806 aa  72  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  39.18 
 
 
566 aa  72  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  36.36 
 
 
806 aa  71.6  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  36.11 
 
 
820 aa  71.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  33.08 
 
 
815 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  31.03 
 
 
639 aa  70.9  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  30.91 
 
 
571 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  35.11 
 
 
774 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  34.06 
 
 
570 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  40.66 
 
 
619 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  40.66 
 
 
619 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.84 
 
 
784 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.84 
 
 
784 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  40.82 
 
 
820 aa  69.3  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.84 
 
 
784 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
786 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  33.33 
 
 
570 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  35.06 
 
 
810 aa  69.3  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
784 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
784 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  34.87 
 
 
810 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
799 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
784 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
784 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
784 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  34.03 
 
 
824 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
793 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  34.19 
 
 
784 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
784 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
784 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
784 aa  68.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  32.64 
 
 
810 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
793 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
784 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
784 aa  68.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
784 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
784 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
784 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  38.32 
 
 
785 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
784 aa  68.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  33.12 
 
 
802 aa  68.6  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  33.59 
 
 
815 aa  68.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  38.32 
 
 
785 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2097  ATP-dependent protease La  44.3 
 
 
790 aa  68.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.19 
 
 
787 aa  67.8  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  35.54 
 
 
816 aa  68.2  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  41.76 
 
 
648 aa  68.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  36.77 
 
 
812 aa  67.8  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  32.06 
 
 
809 aa  67.8  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  33.53 
 
 
835 aa  67.8  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  40.2 
 
 
575 aa  67.8  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  44.3 
 
 
808 aa  67.4  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  44.3 
 
 
812 aa  67.4  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  35.1 
 
 
805 aa  67.4  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  36.18 
 
 
816 aa  67.4  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  44.3 
 
 
812 aa  67.4  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  36.57 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  37.38 
 
 
785 aa  66.6  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  37.38 
 
 
785 aa  66.6  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  38.32 
 
 
783 aa  66.6  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  37.38 
 
 
785 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  37.38 
 
 
785 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  33.11 
 
 
805 aa  67  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  44.3 
 
 
807 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  37.38 
 
 
785 aa  66.6  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  37.38 
 
 
784 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  33.11 
 
 
781 aa  67  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  37.38 
 
 
786 aa  66.6  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  35.06 
 
 
806 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  33.77 
 
 
808 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  33.77 
 
 
807 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  35.06 
 
 
804 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  35.06 
 
 
804 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>