More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0963 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0963  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 
640 aa  1250    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0873  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.2 
 
 
550 aa  211  3e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1960  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.02 
 
 
557 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0794  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.34 
 
 
553 aa  196  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000691143 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0384  hypothetical protein  28.07 
 
 
606 aa  152  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0784776  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0532  hypothetical protein  28.79 
 
 
614 aa  140  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.26777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0315  hypothetical protein  28.5 
 
 
614 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.463593 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1597  hypothetical protein  25.3 
 
 
614 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000203225  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  27.15 
 
 
632 aa  97.8  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.29 
 
 
628 aa  94  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  31.94 
 
 
558 aa  74.3  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  32.56 
 
 
652 aa  73.9  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  30 
 
 
800 aa  63.9  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  30.23 
 
 
639 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  39.29 
 
 
788 aa  62  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  39.29 
 
 
788 aa  62  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
790 aa  60.8  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
787 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
756 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  27.73 
 
 
932 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  31.91 
 
 
650 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  35.54 
 
 
353 aa  59.3  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1658  ATP-dependent protease La  29.23 
 
 
307 aa  58.9  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  32.08 
 
 
793 aa  58.9  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0485  ATP-dependent protease La  28.93 
 
 
830 aa  58.2  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0185488  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  26.92 
 
 
806 aa  58.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  30.22 
 
 
794 aa  58.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  26.92 
 
 
806 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  36.08 
 
 
794 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  26.73 
 
 
558 aa  57.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  34.31 
 
 
809 aa  57  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0880  ATP-dependent protease Lon  27.72 
 
 
637 aa  57  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  29.93 
 
 
309 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  37.97 
 
 
817 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  33.7 
 
 
817 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  33.7 
 
 
816 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  29.31 
 
 
840 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  32.82 
 
 
815 aa  56.2  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
814 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  30.43 
 
 
799 aa  56.2  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  32.98 
 
 
789 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  25.27 
 
 
798 aa  55.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  26.62 
 
 
775 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  40.96 
 
 
537 aa  55.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  30.53 
 
 
825 aa  55.1  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  31.13 
 
 
802 aa  55.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5222  Lon-A peptidase  28.46 
 
 
807 aa  55.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6158  ATP-dependent protease La  28.68 
 
 
807 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1944  ATP-dependent protease La  28.68 
 
 
807 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1921  ATP-dependent protease La  28.68 
 
 
807 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0407  ATP-dependent protease La  27.08 
 
 
810 aa  54.7  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.58 
 
 
348 aa  54.7  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  28.65 
 
 
579 aa  55.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1839  ATP-dependent protease La  28.26 
 
 
807 aa  54.7  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419381  normal  0.0156461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1909  ATP-dependent protease La  28.26 
 
 
807 aa  54.7  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  29.31 
 
 
810 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  29.31 
 
 
812 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  31.03 
 
 
823 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  39.47 
 
 
811 aa  54.3  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  30.17 
 
 
780 aa  54.3  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  39.47 
 
 
796 aa  54.3  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2097  ATP-dependent protease La  40.28 
 
 
790 aa  54.3  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  28.17 
 
 
816 aa  53.9  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1351  ATP-dependent protease La  34.52 
 
 
808 aa  53.9  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.183525 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  30.27 
 
 
570 aa  53.9  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  32.14 
 
 
805 aa  53.5  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  30.09 
 
 
808 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  35.06 
 
 
815 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  28.44 
 
 
825 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0860  ATP-dependent protease La  25.86 
 
 
807 aa  52.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  25.68 
 
 
648 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  27.14 
 
 
803 aa  53.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  28.95 
 
 
808 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  33.71 
 
 
823 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  30.95 
 
 
810 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0470  hypothetical protein  29.51 
 
 
827 aa  52.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  28.45 
 
 
812 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  34.52 
 
 
815 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0599  ATP-dependent protease La  30.99 
 
 
804 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737999  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  25.25 
 
 
804 aa  52.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  31.68 
 
 
807 aa  52.8  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  25.81 
 
 
823 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  29.02 
 
 
571 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  25.86 
 
 
810 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  29.69 
 
 
809 aa  52  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  25 
 
 
835 aa  52.4  0.00003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1659  Lon-A peptidase  31.31 
 
 
875 aa  52  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.241054  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  30.08 
 
 
812 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  28.77 
 
 
815 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  31.3 
 
 
792 aa  52.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  28.12 
 
 
809 aa  52.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  28.95 
 
 
807 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  29.41 
 
 
818 aa  52  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  30.97 
 
 
811 aa  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  29.94 
 
 
570 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  30.4 
 
 
635 aa  52.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  27.4 
 
 
768 aa  51.6  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1899  ATP-dependent protease La  31.31 
 
 
874 aa  52  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67239  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2391  ATP-dependent protease Lon  27.72 
 
 
662 aa  51.6  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.654963 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  32.91 
 
 
807 aa  51.6  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>