More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3727 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 		 350 aa  691    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  61.78 
 
 		 348 aa  413  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  59.48 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  45.27 
 
 		 347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  52.29 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  47.86 
 
 		 348 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  45.66 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  46.65 
 
 		 357 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  44.83 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  46.4 
 
 		 386 aa  264  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  42.36 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  44.38 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  43.68 
 
 		 359 aa  255  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  43.82 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  42.29 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  41.38 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  42.51 
 
 		 383 aa  246  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  42.57 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  42.57 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  45.03 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  42.29 
 
 		 345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  38.64 
 
 		 358 aa  236  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.21 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  43.39 
 
 		 340 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  40.46 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  42.68 
 
 		 374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  42.09 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  38.87 
 
 		 354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  40.69 
 
 		 353 aa  219  5e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  38.33 
 
 		 353 aa  216  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  41.59 
 
 		 355 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  40 
 
 		 355 aa  212  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  42.73 
 
 		 348 aa  212  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.54 
 
 		 441 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  37.39 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  41.5 
 
 		 338 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.33 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.33 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  33.33 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  33.04 
 
 		 340 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  32.46 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  33.04 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  33.04 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  33.04 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  33.04 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  33.04 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  32.17 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.88 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.58 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  55.93 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.44 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  52.99 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.86 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  34.91 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  28.82 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  33.5 
 
 		 363 aa  106  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  27.81 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  27.95 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  29.22 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  26.86 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  37.82 
 
 		 652 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.57 
 
 		 628 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  37.38 
 
 		 800 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  46.81 
 
 		 818 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 813 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  38.95 
 
 		 783 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  43.01 
 
 		 813 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  38.95 
 
 		 786 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  38.71 
 
 		 810 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  35.78 
 
 		 800 aa  61.2  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  37.82 
 
 		 774 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  42.55 
 
 		 799 aa  59.3  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  43.59 
 
 		 812 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  40.43 
 
 		 773 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  40.86 
 
 		 670 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  36.27 
 
 		 815 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  39.78 
 
 		 775 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  40.86 
 
 		 837 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  38.95 
 
 		 801 aa  58.5  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  39.36 
 
 		 815 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2097  ATP-dependent protease La  41.05 
 
 		 790 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 		 783 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  38.95 
 
 		 802 aa  58.5  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  35.42 
 
 		 835 aa  58.2  0.0000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  41.77 
 
 		 779 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 802 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  39.36 
 
 		 773 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  39.36 
 
 		 776 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  38.54 
 
 		 811 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  39.36 
 
 		 773 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  39.36 
 
 		 776 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  39.36 
 
 		 806 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  37.23 
 
 		 806 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  40.43 
 
 		 807 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  40.95 
 
 		 810 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  39.36 
 
 		 776 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  39.36 
 
 		 773 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  34.78 
 
 		 808 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0390  ATP-dependent protease La  42.22 
 
 		 800 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.754053  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  39.36 
 
 		 776 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>