248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13214 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  687    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  70.18 
 
 		 345 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  70.47 
 
 		 342 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  70.47 
 
 		 342 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  67.06 
 
 		 340 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  67.65 
 
 		 359 aa  471  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  46.47 
 
 		 381 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  47.35 
 
 		 386 aa  288  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  44.12 
 
 		 337 aa  275  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  48.32 
 
 		 355 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  44.83 
 
 		 353 aa  272  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  47.35 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  43.8 
 
 		 348 aa  255  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  44.27 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  43.39 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  42.53 
 
 		 348 aa  242  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  40 
 
 		 345 aa  226  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.96 
 
 		 394 aa  225  7e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.86 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  40.48 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.66 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  37.71 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  35.38 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  34.78 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  35.69 
 
 		 358 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.46 
 
 		 441 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  36.08 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  38.22 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  37.05 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.9 
 
 		 376 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  34.33 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  38.98 
 
 		 353 aa  179  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.22 
 
 		 354 aa  175  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  33.13 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  36.14 
 
 		 353 aa  163  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  34.21 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.66 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.69 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.89 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  29.75 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  29.61 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  29.46 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  29.46 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  29.46 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  29.46 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  29.33 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  29.14 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  29.43 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  48.28 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  47.86 
 
 		 295 aa  105  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.56 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.29 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  31.73 
 
 		 363 aa  99.4  7e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.64 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  34.7 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  26.37 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  33.03 
 
 		 358 aa  89.7  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  26.89 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  25.76 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  33.55 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  27.78 
 
 		 558 aa  56.2  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  34.31 
 
 		 652 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  49.23 
 
 		 628 aa  54.3  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  38.89 
 
 		 566 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  30.84 
 
 		 579 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 670 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  37.38 
 
 		 810 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  34.41 
 
 		 570 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  28.21 
 
 		 650 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  36.71 
 
 		 792 aa  50.1  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  40.96 
 
 		 819 aa  50.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  34.58 
 
 		 571 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  37.88 
 
 		 632 aa  49.7  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  45.45 
 
 		 854 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  35.79 
 
 		 803 aa  49.7  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  32.67 
 
 		 570 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  35.78 
 
 		 794 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  35.78 
 
 		 794 aa  49.3  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  31.19 
 
 		 802 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  35.44 
 
 		 800 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  34.41 
 
 		 810 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  32.69 
 
 		 806 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  30.56 
 
 		 809 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  34.34 
 
 		 772 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  39.39 
 
 		 796 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  31.07 
 
 		 639 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  36.19 
 
 		 815 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3246  Endopeptidase La  43.94 
 
 		 789 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171847  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  32.43 
 
 		 802 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  33.98 
 
 		 826 aa  47.8  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  40.58 
 
 		 815 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  30.21 
 
 		 788 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  42.42 
 
 		 1104 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  43.94 
 
 		 801 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  37.23 
 
 		 774 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  34.74 
 
 		 812 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  36 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  31.31 
 
 		 809 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  36.26 
 
 		 825 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  28.97 
 
 		 537 aa  47  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>