More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1875 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 339 aa  694    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  72.4 
 
 		 338 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  50.15 
 
 		 345 aa  342  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  50.15 
 
 		 347 aa  342  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  49.7 
 
 		 341 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  49.7 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  49.4 
 
 		 340 aa  339  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  49.4 
 
 		 340 aa  339  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  49.11 
 
 		 340 aa  338  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  49.11 
 
 		 340 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  49.11 
 
 		 340 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  49.26 
 
 		 341 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  49.4 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  37.93 
 
 		 357 aa  217  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  37.99 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.68 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  37.35 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  38.24 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  36.48 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  34.86 
 
 		 363 aa  189  7e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.74 
 
 		 332 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  31.93 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  35.88 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  31.21 
 
 		 347 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  32.58 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.77 
 
 		 356 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  29.57 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  31.61 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  31.64 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  32.23 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  28.74 
 
 		 348 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  30.48 
 
 		 337 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.97 
 
 		 348 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  31.76 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  30.5 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  32.67 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  29.26 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  31.37 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.29 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.34 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  32.43 
 
 		 374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  28.27 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  30.4 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  29.97 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  29.37 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  34.98 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  34.98 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  34.98 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  30.36 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.27 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  27.06 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  29.29 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  29.28 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  30.19 
 
 		 373 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  31.56 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  29.57 
 
 		 387 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.89 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  36.97 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  32.45 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  36.63 
 
 		 805 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  32 
 
 		 628 aa  60.1  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  31.31 
 
 		 810 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  30.58 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  36.63 
 
 		 803 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  33.33 
 
 		 835 aa  58.2  0.0000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  31.36 
 
 		 537 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 819 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  30 
 
 		 783 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  35 
 
 		 812 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 812 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  30 
 
 		 786 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  33.02 
 
 		 824 aa  56.6  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  33 
 
 		 789 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  34.26 
 
 		 799 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  31.96 
 
 		 787 aa  55.8  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  28.21 
 
 		 558 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  27.08 
 
 		 797 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 791 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  29.33 
 
 		 810 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  29.79 
 
 		 812 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  31.58 
 
 		 570 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  35.29 
 
 		 788 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  34.34 
 
 		 807 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  34.94 
 
 		 570 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 791 aa  53.5  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 791 aa  53.5  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  34.34 
 
 		 808 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0485  ATP-dependent protease La  33 
 
 		 830 aa  53.1  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0185488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  32.67 
 
 		 808 aa  53.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  31.97 
 
 		 817 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  33.66 
 
 		 798 aa  52.8  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  30.69 
 
 		 818 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  32.77 
 
 		 816 aa  52.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  33 
 
 		 816 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  33.66 
 
 		 804 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  34.34 
 
 		 816 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 813 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  31.34 
 
 		 807 aa  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  32 
 
 		 802 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>