More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0112 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  593  1e-169  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  54.23 
 
 		 295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  59.23 
 
 		 353 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  59.48 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  54.69 
 
 		 441 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  54.76 
 
 		 373 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  51.01 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  58.82 
 
 		 348 aa  135  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  56.41 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  46.67 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  48.31 
 
 		 376 aa  125  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  52.99 
 
 		 350 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  55.56 
 
 		 356 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  52.71 
 
 		 374 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  51.67 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  51.72 
 
 		 353 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  56.41 
 
 		 387 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  39.33 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  47.41 
 
 		 386 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  50 
 
 		 316 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  50.42 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  44.44 
 
 		 381 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  38.73 
 
 		 357 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  50.43 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  50.43 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  50.43 
 
 		 345 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  42.57 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  46.72 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.6 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  44.44 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  50.91 
 
 		 353 aa  106  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  51.82 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  46.55 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  48.62 
 
 		 348 aa  99.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  48.28 
 
 		 340 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  44.95 
 
 		 355 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  44.83 
 
 		 359 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  43.97 
 
 		 340 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.44 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.8 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  50.67 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.82 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.94 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  49.32 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.32 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  39.32 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  33.53 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  39.32 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 772 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  32.93 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  32.93 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  38.46 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  32.93 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  32.93 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.29 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  33.53 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  46.58 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  47.22 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  37.82 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  45.33 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 771 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  41.89 
 
 		 357 aa  67  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  32.62 
 
 		 786 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  32.62 
 
 		 783 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  34.53 
 
 		 788 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  36.3 
 
 		 815 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  33.63 
 
 		 796 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  36.04 
 
 		 810 aa  63.2  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  31.34 
 
 		 810 aa  62.4  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  31.34 
 
 		 840 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  31.62 
 
 		 809 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 780 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1979  ATP-dependent protease La  33.59 
 
 		 859 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205373 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  34.92 
 
 		 823 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  27.54 
 
 		 824 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  31.88 
 
 		 807 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  28.38 
 
 		 800 aa  58.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1899  ATP-dependent protease La  35.29 
 
 		 874 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67239  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  32.37 
 
 		 823 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1659  Lon-A peptidase  35.29 
 
 		 875 aa  57  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.241054  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  33.79 
 
 		 773 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  31.85 
 
 		 810 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  33.57 
 
 		 774 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  31.39 
 
 		 932 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 817 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  31.25 
 
 		 806 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  28.99 
 
 		 835 aa  56.2  0.0000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  34.07 
 
 		 815 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  29.31 
 
 		 794 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  33.11 
 
 		 802 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  30.94 
 
 		 812 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  33.57 
 
 		 819 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  32.65 
 
 		 773 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  33.57 
 
 		 812 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4272  ATP-dependent protease La  34.35 
 
 		 775 aa  55.8  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  32.65 
 
 		 776 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  32.65 
 
 		 776 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  32.65 
 
 		 776 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 		 820 aa  55.8  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  32.65 
 
 		 776 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>