More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2629 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 
341 aa  687    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  84.75 
 
 
347 aa  594  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  85.59 
 
 
340 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  85.34 
 
 
345 aa  595  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  85 
 
 
340 aa  593  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  85 
 
 
340 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  85 
 
 
340 aa  593  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  85.46 
 
 
340 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  85 
 
 
340 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  85 
 
 
340 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  83.87 
 
 
341 aa  588  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  52.82 
 
 
338 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  49.7 
 
 
339 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  42.34 
 
 
343 aa  227  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  40.64 
 
 
336 aa  212  7e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  38.75 
 
 
357 aa  205  9e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  34.06 
 
 
363 aa  194  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  34.46 
 
 
364 aa  191  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  36.99 
 
 
358 aa  186  6e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  36.5 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  33.33 
 
 
337 aa  159  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.67 
 
 
337 aa  159  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  34.27 
 
 
316 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.03 
 
 
332 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  31.88 
 
 
350 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  32.64 
 
 
354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  31.74 
 
 
383 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  33.63 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.29 
 
 
348 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  31.29 
 
 
347 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.7 
 
 
348 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  30.88 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  31.07 
 
 
381 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  30.37 
 
 
345 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.79 
 
 
356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  29.64 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  31.05 
 
 
355 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  31.38 
 
 
374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  29.28 
 
 
353 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.9 
 
 
353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.97 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  30.42 
 
 
338 aa  116  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  28.61 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  29.71 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.45 
 
 
342 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.45 
 
 
342 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  28.61 
 
 
345 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.35 
 
 
441 aa  113  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  28.05 
 
 
340 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  27.35 
 
 
395 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.84 
 
 
394 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  29.28 
 
 
353 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  31.97 
 
 
355 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  32.66 
 
 
387 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  29.55 
 
 
340 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  27.49 
 
 
358 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  29.45 
 
 
373 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  40.17 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.56 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  39.29 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  39 
 
 
805 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  37 
 
 
803 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  34.55 
 
 
812 aa  60.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  30 
 
 
810 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  35.29 
 
 
835 aa  60.1  0.00000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  35.45 
 
 
812 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  34.13 
 
 
791 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  32.71 
 
 
810 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  35.35 
 
 
812 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  31.31 
 
 
786 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  35.35 
 
 
819 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  31.31 
 
 
783 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  34.65 
 
 
558 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  36 
 
 
798 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
810 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  35 
 
 
807 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  35.51 
 
 
816 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1955  ATP-dependent protease La  34.58 
 
 
805 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  34.58 
 
 
805 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  34.58 
 
 
807 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  34.58 
 
 
805 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1230  ATP-dependent protease La  34.58 
 
 
805 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3350  ATP-dependent protease La  34.58 
 
 
805 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464678  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  34.58 
 
 
806 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  35.19 
 
 
803 aa  57  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  35.35 
 
 
816 aa  57.4  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2321  ATP-dependent protease La  34.58 
 
 
805 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00784653  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2363  ATP-dependent protease La  34.58 
 
 
805 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  34.58 
 
 
807 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  35.78 
 
 
817 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  34.58 
 
 
805 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  34.55 
 
 
821 aa  56.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  35.35 
 
 
810 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  31.48 
 
 
818 aa  55.8  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  34.34 
 
 
797 aa  56.2  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  34.31 
 
 
791 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  35.19 
 
 
807 aa  55.8  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  34.26 
 
 
820 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  32.41 
 
 
811 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  30.19 
 
 
824 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>