217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1258 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  100 
 
 
364 aa  737    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  54.33 
 
 
363 aa  359  3e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  45.78 
 
 
350 aa  278  1e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  39.82 
 
 
343 aa  227  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  39.63 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  39.05 
 
 
336 aa  212  7.999999999999999e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  37.92 
 
 
358 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  34.75 
 
 
347 aa  196  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  34.75 
 
 
345 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  35.03 
 
 
340 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  34.46 
 
 
340 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  34.18 
 
 
340 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.46 
 
 
341 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  34.18 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  34.18 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  34.18 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  34.18 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.53 
 
 
341 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.77 
 
 
338 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.93 
 
 
339 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.14 
 
 
337 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.33 
 
 
348 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  28.3 
 
 
348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  30 
 
 
374 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  33.89 
 
 
345 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.89 
 
 
342 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.89 
 
 
342 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  27.81 
 
 
350 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.35 
 
 
332 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  28.44 
 
 
381 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.31 
 
 
353 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  28.32 
 
 
316 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  25.21 
 
 
337 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.28 
 
 
386 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.43 
 
 
356 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.62 
 
 
354 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.36 
 
 
394 aa  96.7  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  23.92 
 
 
383 aa  96.3  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  27.71 
 
 
345 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  32.4 
 
 
359 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.24 
 
 
348 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  32.96 
 
 
340 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  27.48 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  27.57 
 
 
357 aa  86.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  32.16 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  26.65 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  26.37 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  32.04 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.58 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  29.48 
 
 
353 aa  77  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  25.4 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  28.42 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  49.32 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  46.05 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  30.97 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  27 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  28.52 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  23.1 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.55 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  26.01 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  35.48 
 
 
652 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  38.81 
 
 
309 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  31.48 
 
 
787 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  31.48 
 
 
756 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  31.15 
 
 
648 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  40.91 
 
 
496 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  25.93 
 
 
819 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.36 
 
 
628 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  38.96 
 
 
801 aa  50.8  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  35.35 
 
 
419 aa  50.1  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  39.39 
 
 
474 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  39.39 
 
 
474 aa  49.7  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  39.39 
 
 
474 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  39.39 
 
 
474 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  39.39 
 
 
474 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  39.39 
 
 
474 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  39.39 
 
 
474 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  39.39 
 
 
474 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  39.06 
 
 
854 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  28.35 
 
 
816 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  37.88 
 
 
475 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 
806 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  37.88 
 
 
478 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  37.88 
 
 
475 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  37.88 
 
 
478 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  39.39 
 
 
474 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  34.18 
 
 
836 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  37.88 
 
 
475 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1658  ATP-dependent protease La  46.15 
 
 
307 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  35.94 
 
 
810 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  34.62 
 
 
570 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  31.08 
 
 
817 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  32.09 
 
 
808 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  32.91 
 
 
835 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  39.06 
 
 
783 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  36 
 
 
476 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  39.06 
 
 
786 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  35.62 
 
 
796 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  43.08 
 
 
455 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  36.25 
 
 
514 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>