228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27490 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  100 
 
 		 395 aa  776    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  56.64 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  55.14 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  57.59 
 
 		 353 aa  358  8e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  52.54 
 
 		 358 aa  346  5e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  48.18 
 
 		 342 aa  278  9e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  44.09 
 
 		 348 aa  263  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  41.5 
 
 		 348 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  44.48 
 
 		 387 aa  252  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  44.38 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  44.35 
 
 		 383 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  44.19 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  40.29 
 
 		 347 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  40.46 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  43.85 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  42.69 
 
 		 357 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.09 
 
 		 356 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.66 
 
 		 348 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.97 
 
 		 394 aa  206  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.22 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  40.12 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.14 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  39.44 
 
 		 381 aa  200  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.72 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  39.51 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.72 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  37.72 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  40.06 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  35.98 
 
 		 359 aa  189  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  34.78 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  34.65 
 
 		 340 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  39.51 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.36 
 
 		 386 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  37.89 
 
 		 338 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.26 
 
 		 332 aa  159  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  37.24 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  58.33 
 
 		 295 aa  151  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  34.35 
 
 		 355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  59.48 
 
 		 293 aa  146  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.38 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  28.75 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  28.12 
 
 		 340 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  28.12 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  28.12 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  28.44 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  28.44 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  28.75 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.06 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  27.81 
 
 		 345 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  28.12 
 
 		 347 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.16 
 
 		 338 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.37 
 
 		 339 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.35 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  30.24 
 
 		 358 aa  99.4  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  29.07 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  27.8 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  26.18 
 
 		 357 aa  86.3  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  29.82 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  25.4 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  30.84 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  36.73 
 
 		 801 aa  54.3  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  38.54 
 
 		 818 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  37.5 
 
 		 932 aa  53.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  39.78 
 
 		 805 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  36.84 
 
 		 802 aa  52.8  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  38.95 
 
 		 799 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  37.63 
 
 		 805 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  36 
 
 		 807 aa  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  39.22 
 
 		 867 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  46.77 
 
 		 455 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  46.77 
 
 		 455 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 		 802 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  46.77 
 
 		 455 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  46.77 
 
 		 451 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  45.16 
 
 		 455 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  46.77 
 
 		 455 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  45.16 
 
 		 455 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  45.16 
 
 		 455 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  45.16 
 
 		 455 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  31.82 
 
 		 796 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  45.16 
 
 		 455 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  45.16 
 
 		 455 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  45.16 
 
 		 455 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  45.16 
 
 		 455 aa  50.4  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  31.07 
 
 		 809 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 805 aa  50.4  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  45.16 
 
 		 455 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  33.87 
 
 		 815 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  43.55 
 
 		 455 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  35.79 
 
 		 804 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  38.78 
 
 		 813 aa  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  36.46 
 
 		 806 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  39.13 
 
 		 807 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  34.21 
 
 		 801 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  38.3 
 
 		 808 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  39.76 
 
 		 806 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 809 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  31.48 
 
 		 619 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  31.48 
 
 		 619 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  38.24 
 
 		 802 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>