More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0475 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 		 394 aa  789    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  44.85 
 
 		 348 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  45.38 
 
 		 348 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  42.22 
 
 		 350 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  40.56 
 
 		 340 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  39.34 
 
 		 359 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.46 
 
 		 356 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  39.94 
 
 		 345 aa  229  8e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.67 
 
 		 342 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.67 
 
 		 342 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  40.79 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  41.35 
 
 		 381 aa  224  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.34 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  40.96 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.22 
 
 		 353 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  40.55 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  37.23 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  37.57 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  37.14 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  42.3 
 
 		 345 aa  203  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.59 
 
 		 441 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  36.47 
 
 		 358 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  36.11 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  36.99 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.06 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  38.57 
 
 		 353 aa  189  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  38.2 
 
 		 374 aa  186  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  33.87 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.46 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  37.31 
 
 		 355 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  38.14 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.28 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  36.74 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  37.79 
 
 		 348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  34.99 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  32.4 
 
 		 353 aa  150  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.77 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.35 
 
 		 339 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.88 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.58 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  50 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  29.72 
 
 		 336 aa  113  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.84 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  27.82 
 
 		 345 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  28.49 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  28.21 
 
 		 340 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  28.21 
 
 		 340 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  27.55 
 
 		 347 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  28.21 
 
 		 340 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  27.93 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  27.93 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  27.93 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.23 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  45.6 
 
 		 293 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  31.65 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  30.67 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  28.99 
 
 		 357 aa  97.8  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  31.11 
 
 		 364 aa  96.7  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  29.5 
 
 		 350 aa  92.8  8e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  29.66 
 
 		 363 aa  89  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  36.17 
 
 		 652 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  35.87 
 
 		 670 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  39.18 
 
 		 837 aa  59.7  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  40.21 
 
 		 799 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  40.62 
 
 		 813 aa  57.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  37.23 
 
 		 805 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  31.91 
 
 		 810 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  32.98 
 
 		 783 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  38.78 
 
 		 802 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  30.16 
 
 		 579 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 810 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 812 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  37.5 
 
 		 799 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 812 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  33.04 
 
 		 806 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  33.63 
 
 		 571 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  32.98 
 
 		 786 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 		 807 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  32.67 
 
 		 648 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  33.9 
 
 		 806 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  38.14 
 
 		 818 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  43.48 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  40.51 
 
 		 800 aa  53.5  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  37.11 
 
 		 802 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0404  Lon-B peptidase  32.67 
 
 		 692 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.175581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  38 
 
 		 823 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  35.79 
 
 		 802 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  36.08 
 
 		 802 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  30.23 
 
 		 635 aa  53.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 		 788 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  38.14 
 
 		 801 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  28.95 
 
 		 570 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  38 
 
 		 808 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.27 
 
 		 628 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  36.08 
 
 		 802 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 826 aa  52  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  35.87 
 
 		 807 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  35.05 
 
 		 797 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  48.48 
 
 		 854 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  34.78 
 
 		 808 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>