299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3730 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  616  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  89.24 
 
 		 337 aa  551  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  50.48 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  45.74 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  46.18 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  46.25 
 
 		 345 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  46.25 
 
 		 342 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  46.25 
 
 		 342 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  47.27 
 
 		 348 aa  266  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  47.77 
 
 		 381 aa  255  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  44.41 
 
 		 348 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  46.25 
 
 		 348 aa  249  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  44.73 
 
 		 338 aa  245  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  44.31 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  44.27 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  45.03 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  43.81 
 
 		 386 aa  242  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  44.71 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  42.94 
 
 		 356 aa  228  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  44.59 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  43.85 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  44.52 
 
 		 354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  43.44 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  45.03 
 
 		 373 aa  219  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  39.08 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  40.97 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  40.12 
 
 		 357 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  38.96 
 
 		 358 aa  205  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  44.03 
 
 		 387 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.55 
 
 		 394 aa  202  7e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  42.36 
 
 		 441 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  38.96 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  41.11 
 
 		 374 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  41.4 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.12 
 
 		 376 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  39.94 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.27 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.45 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  33.54 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  33.54 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  33.54 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  33.54 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  33.23 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  33.23 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  33.84 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  32.93 
 
 		 347 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  32.93 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.56 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.82 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.61 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.6 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  31.88 
 
 		 358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  50 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  51.89 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  26.01 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  28.32 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  36.07 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  30.18 
 
 		 343 aa  99.8  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  29.35 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  30.65 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  38.3 
 
 		 810 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  24.78 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  40.86 
 
 		 801 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  25.33 
 
 		 579 aa  55.8  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  40.86 
 
 		 652 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  38.71 
 
 		 815 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  39.78 
 
 		 813 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  34.78 
 
 		 566 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  35.48 
 
 		 800 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  39 
 
 		 809 aa  53.1  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  39.36 
 
 		 805 aa  52.8  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  37.23 
 
 		 803 aa  52.4  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  35.48 
 
 		 809 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  34.41 
 
 		 639 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  31.58 
 
 		 650 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  39.78 
 
 		 799 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  34.41 
 
 		 783 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  35.42 
 
 		 788 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  36.73 
 
 		 803 aa  50.8  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  35.48 
 
 		 807 aa  50.8  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  34.41 
 
 		 786 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.88 
 
 		 628 aa  50.4  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  42.86 
 
 		 932 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  43.48 
 
 		 655 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  38.57 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  37.63 
 
 		 773 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  34.41 
 
 		 479 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  34.41 
 
 		 491 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0764  ATP-dependent protease La  36.14 
 
 		 774 aa  49.7  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  34.15 
 
 		 796 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  34.82 
 
 		 821 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 817 aa  49.7  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  34.15 
 
 		 811 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  37.84 
 
 		 809 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  36.19 
 
 		 792 aa  49.3  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  37.63 
 
 		 805 aa  49.3  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  36.56 
 
 		 776 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  36.56 
 
 		 773 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  36.56 
 
 		 776 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  36.56 
 
 		 773 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>