92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1612 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1612  protease  100 
 
 
358 aa  721    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  61.13 
 
 
357 aa  419  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  50 
 
 
343 aa  304  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  43.87 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  39.27 
 
 
363 aa  232  8.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  37.32 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  37.75 
 
 
336 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.5 
 
 
338 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  38.04 
 
 
340 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  38.33 
 
 
340 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  38.62 
 
 
340 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  38.04 
 
 
340 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  38.04 
 
 
340 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  38.04 
 
 
340 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  38.04 
 
 
340 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  37.75 
 
 
347 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  37.75 
 
 
345 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.75 
 
 
341 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.47 
 
 
339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.73 
 
 
341 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.09 
 
 
332 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.99 
 
 
337 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  30.97 
 
 
337 aa  119  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  30.45 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  31.88 
 
 
316 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.27 
 
 
356 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.66 
 
 
354 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.1 
 
 
348 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  44 
 
 
348 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.03 
 
 
353 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  33.09 
 
 
355 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  26.89 
 
 
383 aa  102  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  29.41 
 
 
340 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  33.79 
 
 
374 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.67 
 
 
386 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  28.37 
 
 
350 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  30.24 
 
 
395 aa  99.4  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.67 
 
 
394 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  28.34 
 
 
359 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  32.18 
 
 
358 aa  97.8  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  30.77 
 
 
353 aa  97.4  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  30.27 
 
 
345 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  28.85 
 
 
345 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.85 
 
 
342 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.85 
 
 
342 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  28.12 
 
 
348 aa  95.9  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  27.27 
 
 
347 aa  92.8  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  33.18 
 
 
373 aa  90.1  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  32.47 
 
 
348 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  35.05 
 
 
342 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.88 
 
 
376 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  30.04 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  27.62 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  29.69 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  29.25 
 
 
340 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  30.48 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  25.23 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.9 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  35.82 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  47.22 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.58 
 
 
628 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0384  hypothetical protein  27.5 
 
 
606 aa  51.6  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0784776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  45.83 
 
 
496 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0963  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.42 
 
 
640 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  32.31 
 
 
632 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  30.09 
 
 
508 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0532  hypothetical protein  26.67 
 
 
614 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.26777  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1960  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.74 
 
 
557 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3622  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.43 
 
 
486 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0344622  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  30.53 
 
 
485 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0873  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.54 
 
 
550 aa  46.6  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  28.83 
 
 
558 aa  46.6  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1597  hypothetical protein  26.67 
 
 
614 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000203225  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0315  hypothetical protein  31.94 
 
 
614 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.463593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 
810 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0794  peptidase S16, lon domain-containing protein  40 
 
 
553 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000691143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1186  HtrA2 peptidase  41.3 
 
 
597 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.934322  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl404  class III heat shock DNA-binding ATP dependent Lon protease  30.43 
 
 
787 aa  45.1  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  28.7 
 
 
786 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  39.58 
 
 
496 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  39.58 
 
 
496 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  35.14 
 
 
575 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 
783 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  26.45 
 
 
504 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  37.1 
 
 
482 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  31.88 
 
 
501 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  36.92 
 
 
570 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  27.52 
 
 
816 aa  43.1  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  26.45 
 
 
502 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  35.38 
 
 
570 aa  42.7  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  31.75 
 
 
474 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1408  peptidase S16, Lon-like protease  26.22 
 
 
631 aa  42.7  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>