More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1528 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 354 aa  707    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  43.02 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  39.49 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.44 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  44.52 
 
 		 316 aa  226  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  43.24 
 
 		 337 aa  225  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  38.87 
 
 		 350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.6 
 
 		 348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  39.77 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  42.02 
 
 		 345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  40.86 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  38.69 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.12 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  40.5 
 
 		 353 aa  202  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  39.14 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  40.75 
 
 		 387 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  40.42 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.57 
 
 		 386 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.68 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  39.14 
 
 		 373 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  39.53 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  39.4 
 
 		 374 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.39 
 
 		 353 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  39.43 
 
 		 355 aa  186  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  37.98 
 
 		 358 aa  183  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  40.12 
 
 		 353 aa  179  5.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  40.98 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  37.15 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  35.71 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.38 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.38 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.62 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.28 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  35.09 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  37.22 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  31.27 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  31.34 
 
 		 340 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  31.34 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  31.04 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  31.34 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  31.04 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  31.04 
 
 		 340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.64 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.34 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  30.45 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  30.15 
 
 		 347 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.56 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  32.17 
 
 		 355 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.23 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.77 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  31.16 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  35.16 
 
 		 358 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.59 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  45.59 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  44.85 
 
 		 295 aa  105  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  29.58 
 
 		 343 aa  99.4  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  28.62 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  31.25 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  27.48 
 
 		 357 aa  96.7  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  28.52 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  48.48 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  40.74 
 
 		 652 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  33.06 
 
 		 785 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  38.71 
 
 		 477 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  38.71 
 
 		 477 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.89 
 
 		 628 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  33.62 
 
 		 797 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  30.39 
 
 		 810 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  33.06 
 
 		 785 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  32.26 
 
 		 781 aa  54.7  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 		 800 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  44.12 
 
 		 570 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  35.71 
 
 		 835 aa  54.3  0.000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  32.26 
 
 		 784 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  32.26 
 
 		 785 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  42.65 
 
 		 570 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  32.26 
 
 		 785 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  32.26 
 
 		 785 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  33.06 
 
 		 785 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  33.63 
 
 		 821 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  33.62 
 
 		 820 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  35.48 
 
 		 791 aa  53.5  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  33.63 
 
 		 812 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  32.26 
 
 		 785 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  32.26 
 
 		 785 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  37.84 
 
 		 808 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  33.06 
 
 		 785 aa  53.5  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  35.48 
 
 		 791 aa  53.5  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  31.45 
 
 		 785 aa  53.5  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  34.21 
 
 		 809 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  32.26 
 
 		 785 aa  53.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  31.01 
 
 		 803 aa  53.1  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  32.26 
 
 		 785 aa  53.1  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  31.45 
 
 		 786 aa  53.1  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  34.41 
 
 		 791 aa  53.1  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0263  DNA-binding ATP-dependent protease La  30.65 
 
 		 784 aa  53.1  0.000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  30.65 
 
 		 783 aa  52.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  32.61 
 
 		 805 aa  52.8  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  33.67 
 
 		 783 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  38.1 
 
 		 619 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>