More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8344 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  694    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  64.08 
 
 		 348 aa  461  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  59.48 
 
 		 350 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  49.86 
 
 		 347 aa  341  8e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  46.29 
 
 		 348 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  45.22 
 
 		 357 aa  285  9e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  49 
 
 		 345 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  43.86 
 
 		 342 aa  282  6.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  46.38 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  45.43 
 
 		 356 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  44.07 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.85 
 
 		 394 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  43.75 
 
 		 376 aa  265  8.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  43.68 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  42.31 
 
 		 337 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  41.5 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  42.01 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  43.02 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  44.41 
 
 		 316 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  42.57 
 
 		 342 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  42.57 
 
 		 342 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.46 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  42.29 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.81 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.91 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  40.35 
 
 		 340 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  40.63 
 
 		 359 aa  245  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  43.8 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  40.94 
 
 		 353 aa  237  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  37.89 
 
 		 373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  40.58 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  41.95 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  41.78 
 
 		 374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  40.76 
 
 		 353 aa  215  9e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  40.73 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  36.94 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.82 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.02 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  34.43 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  33.73 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  33.43 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  33.43 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  33.43 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  33.24 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  33.43 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  33.72 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  33.72 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.63 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.29 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.81 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  51.67 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.74 
 
 		 339 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  46.67 
 
 		 293 aa  126  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  28.3 
 
 		 364 aa  114  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  30.06 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  29.62 
 
 		 350 aa  97.1  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  28.67 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  32.47 
 
 		 358 aa  89.7  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  27.78 
 
 		 363 aa  87.8  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  28.44 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  36.19 
 
 		 652 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  33 
 
 		 932 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  35.92 
 
 		 670 aa  59.3  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.51 
 
 		 628 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 810 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  35.05 
 
 		 783 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  37.97 
 
 		 807 aa  57  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  37.36 
 
 		 801 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  31.15 
 
 		 809 aa  56.6  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  31.85 
 
 		 812 aa  55.8  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  37.97 
 
 		 815 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  38.78 
 
 		 818 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 		 786 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  29.66 
 
 		 812 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  34.04 
 
 		 799 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  38.54 
 
 		 570 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  30.91 
 
 		 650 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  34.02 
 
 		 809 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  43.04 
 
 		 807 aa  54.7  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  35.79 
 
 		 805 aa  54.3  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  36.56 
 
 		 558 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  32 
 
 		 619 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  32 
 
 		 619 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  30.91 
 
 		 791 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 796 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  38.54 
 
 		 570 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  35.48 
 
 		 813 aa  53.5  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 798 aa  53.5  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  36.46 
 
 		 807 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  34.04 
 
 		 807 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  28.21 
 
 		 810 aa  53.1  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  30.91 
 
 		 791 aa  53.1  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  27.42 
 
 		 788 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  30.91 
 
 		 791 aa  53.1  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  40.51 
 
 		 776 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  40.51 
 
 		 773 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  40.51 
 
 		 773 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  40.51 
 
 		 773 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  40.51 
 
 		 773 aa  52.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  40.51 
 
 		 776 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>