More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19080 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  100 
 
 		 374 aa  739    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  48.21 
 
 		 383 aa  282  6.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  42 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  41.28 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  39.43 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  42.17 
 
 		 373 aa  229  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.86 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  42.24 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.4 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  40.75 
 
 		 353 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  39.17 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  39.65 
 
 		 342 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  40.39 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  40.52 
 
 		 337 aa  209  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  42.77 
 
 		 353 aa  208  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  38.46 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  37.85 
 
 		 347 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.44 
 
 		 356 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  39.55 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.83 
 
 		 348 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  38.11 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  39.88 
 
 		 316 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.02 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  39.52 
 
 		 357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.99 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.62 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.62 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  33.71 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  37.11 
 
 		 338 aa  176  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  32.79 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  32.19 
 
 		 340 aa  169  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  33.14 
 
 		 340 aa  165  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  34.45 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  36.16 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  35.18 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  35.74 
 
 		 348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.02 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  34.81 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  34.49 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  34.18 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  33.86 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  34.18 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.19 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  33.86 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  33.86 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  34.18 
 
 		 347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  33.86 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  52.71 
 
 		 293 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.92 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  51.2 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.66 
 
 		 339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.17 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.87 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  29.32 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  35.03 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  35.58 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  33.62 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  27.3 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  28.47 
 
 		 363 aa  94  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  27.46 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  42.2 
 
 		 652 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  39.81 
 
 		 815 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  36.36 
 
 		 774 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  32.8 
 
 		 807 aa  61.2  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  31.34 
 
 		 800 aa  60.5  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  33.96 
 
 		 813 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  39.25 
 
 		 820 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 768 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  36.13 
 
 		 813 aa  57.4  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  34.78 
 
 		 815 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  34.75 
 
 		 792 aa  57  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  37.29 
 
 		 798 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  33.91 
 
 		 817 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  30.07 
 
 		 836 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  31.79 
 
 		 807 aa  56.2  0.0000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  30.36 
 
 		 619 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  30.36 
 
 		 619 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  34.86 
 
 		 773 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  40.86 
 
 		 819 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  33.09 
 
 		 804 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.62 
 
 		 628 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  31.48 
 
 		 537 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  35.77 
 
 		 820 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  33.94 
 
 		 776 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  40.35 
 
 		 854 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1380  peptidase M50  26.67 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.338907  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1042  endopeptidase La  39.64 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.384061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  35.71 
 
 		 798 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  30.95 
 
 		 806 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  38.54 
 
 		 816 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 		 867 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  33.94 
 
 		 773 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  33.94 
 
 		 776 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  33.94 
 
 		 776 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  34.19 
 
 		 558 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  33.94 
 
 		 773 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  33.94 
 
 		 776 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  30.3 
 
 		 575 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  33.94 
 
 		 776 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  33.94 
 
 		 776 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>