More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1042 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1042  endopeptidase La  100 
 
 		 266 aa  507  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.384061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5508  ATP-dependent protease La  90.75 
 
 		 835 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3246  Endopeptidase La  78.72 
 
 		 789 aa  352  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171847  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  78.6 
 
 		 798 aa  342  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5873  ATP-dependent protease La  78.48 
 
 		 785 aa  328  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  84.76 
 
 		 854 aa  327  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2249  ATP-dependent protease La  69.47 
 
 		 778 aa  290  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.622317  normal  0.359605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0599  ATP-dependent protease La  65.95 
 
 		 804 aa  275  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3064  ATP-dependent protease La  67.3 
 
 		 776 aa  265  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.870237  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3336  ATP-dependent protease La  68.1 
 
 		 780 aa  265  8e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594281  normal  0.0410698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2802  ATP-dependent protease La  65.16 
 
 		 783 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.289517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2775  ATP-dependent protease La  65.16 
 
 		 783 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.560852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2819  ATP-dependent protease La  65.16 
 
 		 783 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246765  normal  0.027393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4272  ATP-dependent protease La  62.78 
 
 		 775 aa  261  8e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41949  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3988  ATP-dependent protease La  63.8 
 
 		 769 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.180349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2928  ATP-dependent protease La  62.83 
 
 		 760 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0257746  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6716  ATP-dependent protease La  55.75 
 
 		 798 aa  226  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.902322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  56.8 
 
 		 828 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  53.1 
 
 		 812 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  53.39 
 
 		 846 aa  219  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  54.71 
 
 		 843 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  52.7 
 
 		 840 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  51.8 
 
 		 817 aa  215  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  56.31 
 
 		 835 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  56.31 
 
 		 835 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  55.77 
 
 		 821 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  48.92 
 
 		 798 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  51.12 
 
 		 808 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  54.3 
 
 		 812 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  52.04 
 
 		 815 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  54.46 
 
 		 805 aa  211  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  52.7 
 
 		 819 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  50.91 
 
 		 797 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  48.42 
 
 		 792 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  50.24 
 
 		 778 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  50.46 
 
 		 817 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  52.17 
 
 		 815 aa  209  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  51.61 
 
 		 772 aa  209  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  54.55 
 
 		 797 aa  209  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  53.81 
 
 		 802 aa  208  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5717  ATP-dependent protease La  52.59 
 
 		 804 aa  208  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.548129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  53.42 
 
 		 792 aa  208  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  56.16 
 
 		 823 aa  208  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  52.43 
 
 		 793 aa  208  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  50 
 
 		 768 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  51.82 
 
 		 812 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  54.72 
 
 		 793 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  50.45 
 
 		 816 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  52.04 
 
 		 788 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  52.04 
 
 		 788 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  49.77 
 
 		 773 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  54.55 
 
 		 856 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  49.77 
 
 		 776 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  54.33 
 
 		 813 aa  205  5e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  51.2 
 
 		 783 aa  205  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  53.64 
 
 		 793 aa  205  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  51.69 
 
 		 776 aa  204  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  51.67 
 
 		 786 aa  205  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  51.69 
 
 		 776 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  51.69 
 
 		 773 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  51.69 
 
 		 776 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  49.31 
 
 		 806 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  48.43 
 
 		 794 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  51.69 
 
 		 776 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  50.67 
 
 		 823 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  47.73 
 
 		 817 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  56.15 
 
 		 776 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  51.69 
 
 		 773 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  56.15 
 
 		 776 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  50 
 
 		 817 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  47.73 
 
 		 779 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  47.98 
 
 		 794 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  50 
 
 		 880 aa  202  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  52.94 
 
 		 797 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  51.21 
 
 		 773 aa  201  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  50 
 
 		 797 aa  201  8e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  50 
 
 		 774 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  53.62 
 
 		 810 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  53.09 
 
 		 771 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  50 
 
 		 785 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  51.63 
 
 		 824 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  52.51 
 
 		 786 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  46.7 
 
 		 815 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  48.43 
 
 		 801 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  52.02 
 
 		 802 aa  198  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  44.96 
 
 		 788 aa  198  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  51.01 
 
 		 772 aa  198  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  52.49 
 
 		 811 aa  198  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  47.06 
 
 		 810 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  50.23 
 
 		 836 aa  198  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  51.61 
 
 		 788 aa  198  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  48.86 
 
 		 775 aa  198  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  56.67 
 
 		 768 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  49.1 
 
 		 785 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  48.65 
 
 		 783 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  49.56 
 
 		 810 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  50.23 
 
 		 835 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  51.12 
 
 		 780 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  49.55 
 
 		 823 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  54.59 
 
 		 772 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>