More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1387 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.16 
 
 		 784 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  43.16 
 
 		 784 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  43.6 
 
 		 768 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  44.31 
 
 		 807 aa  671    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  48.31 
 
 		 819 aa  728    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.16 
 
 		 784 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  43.81 
 
 		 810 aa  637    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  44.24 
 
 		 809 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  43.66 
 
 		 806 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  46.13 
 
 		 773 aa  693    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  44.97 
 
 		 756 aa  635    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0485  ATP-dependent protease La  42.56 
 
 		 830 aa  642    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0185488  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  43.23 
 
 		 785 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  43.82 
 
 		 806 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  46.26 
 
 		 776 aa  696    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  46.13 
 
 		 776 aa  694    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  46.13 
 
 		 776 aa  694    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  45.01 
 
 		 810 aa  671    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  46.83 
 
 		 835 aa  704    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  43.81 
 
 		 802 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  43.23 
 
 		 784 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  43.39 
 
 		 815 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  46.63 
 
 		 836 aa  695    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  44.07 
 
 		 802 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.16 
 
 		 784 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  43.32 
 
 		 808 aa  639    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  43.34 
 
 		 802 aa  638    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  100 
 
 		 772 aa  1555    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  43.36 
 
 		 785 aa  638    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  43.36 
 
 		 785 aa  638    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  43.81 
 
 		 802 aa  647    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  48.05 
 
 		 780 aa  707    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  44.34 
 
 		 801 aa  660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  44.33 
 
 		 796 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  45.87 
 
 		 773 aa  682    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  43.86 
 
 		 805 aa  656    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  43.83 
 
 		 774 aa  648    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  49.35 
 
 		 823 aa  753    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  42.39 
 
 		 808 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  48.37 
 
 		 809 aa  699    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  46.26 
 
 		 773 aa  696    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2097  ATP-dependent protease La  47.03 
 
 		 790 aa  701    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.5 
 
 		 784 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  45.19 
 
 		 806 aa  649    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  48.83 
 
 		 768 aa  721    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  42.89 
 
 		 808 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  49.22 
 
 		 843 aa  721    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  45.74 
 
 		 812 aa  684    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  44.49 
 
 		 817 aa  687    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  46.52 
 
 		 820 aa  712    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  47.46 
 
 		 815 aa  721    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  51.7 
 
 		 802 aa  719    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  49.09 
 
 		 828 aa  726    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  46.75 
 
 		 797 aa  704    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  45.58 
 
 		 810 aa  715    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  48.57 
 
 		 817 aa  744    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  44.27 
 
 		 811 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  46.19 
 
 		 792 aa  695    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  47.63 
 
 		 815 aa  691    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  42.5 
 
 		 784 aa  636    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  45.22 
 
 		 772 aa  679    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  44.05 
 
 		 816 aa  658    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  43.19 
 
 		 806 aa  654    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  43.29 
 
 		 806 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  44.17 
 
 		 813 aa  663    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.68 
 
 		 784 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  43.71 
 
 		 798 aa  658    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  49.22 
 
 		 814 aa  729    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  45.68 
 
 		 778 aa  704    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  45.87 
 
 		 773 aa  690    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  43.69 
 
 		 802 aa  649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  43.78 
 
 		 817 aa  654    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  48.29 
 
 		 786 aa  720    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  45.83 
 
 		 797 aa  695    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  45.18 
 
 		 804 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  44.05 
 
 		 813 aa  666    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  42.84 
 
 		 776 aa  645    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  42.84 
 
 		 776 aa  643    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.16 
 
 		 784 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  44.79 
 
 		 787 aa  636    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  44.4 
 
 		 816 aa  654    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  43.16 
 
 		 812 aa  637    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  47.33 
 
 		 812 aa  702    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  41.97 
 
 		 818 aa  636    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1146  ATP-dependent protease La  46.79 
 
 		 801 aa  699    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  44.98 
 
 		 821 aa  643    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  45.02 
 
 		 823 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  43.99 
 
 		 815 aa  650    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  45.86 
 
 		 790 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3640  Lon-A peptidase  44.6 
 
 		 812 aa  642    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0005782  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.16 
 
 		 784 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  45.5 
 
 		 823 aa  693    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  45.28 
 
 		 771 aa  677    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  45.24 
 
 		 805 aa  662    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  51.44 
 
 		 802 aa  707    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  43.43 
 
 		 809 aa  636    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  44.14 
 
 		 805 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  43.52 
 
 		 821 aa  654    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  48.69 
 
 		 856 aa  720    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  43.88 
 
 		 808 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>