More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0620 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.06 
 
 		 784 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  44.06 
 
 		 784 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  43.47 
 
 		 802 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  44.09 
 
 		 807 aa  651    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  45.2 
 
 		 819 aa  690    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  42.82 
 
 		 806 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 810 aa  1655    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.06 
 
 		 784 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  44.39 
 
 		 806 aa  646    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  44.19 
 
 		 819 aa  643    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  42.89 
 
 		 818 aa  642    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  45.11 
 
 		 806 aa  677    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  43.37 
 
 		 785 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  43.51 
 
 		 805 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  56.98 
 
 		 816 aa  921    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.06 
 
 		 784 aa  637    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  44.15 
 
 		 815 aa  672    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  44.44 
 
 		 802 aa  655    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  43.55 
 
 		 807 aa  644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  43.95 
 
 		 785 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  44.43 
 
 		 835 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  43.95 
 
 		 781 aa  638    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1211  ATP-dependent protease La  44.19 
 
 		 817 aa  636    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  47.24 
 
 		 810 aa  719    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  56.87 
 
 		 817 aa  906    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  42.89 
 
 		 808 aa  635    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.06 
 
 		 784 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  43.81 
 
 		 772 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  43.65 
 
 		 810 aa  639    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  45.82 
 
 		 817 aa  692    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  43.6 
 
 		 802 aa  650    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  41.11 
 
 		 780 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  42.75 
 
 		 804 aa  636    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  45.4 
 
 		 801 aa  669    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.93 
 
 		 784 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  43.36 
 
 		 804 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  43.87 
 
 		 805 aa  663    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  45.98 
 
 		 797 aa  684    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  44.79 
 
 		 823 aa  676    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  43.47 
 
 		 806 aa  646    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  44.69 
 
 		 809 aa  673    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  43.38 
 
 		 815 aa  649    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.93 
 
 		 784 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  45.16 
 
 		 816 aa  693    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.06 
 
 		 784 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  44.68 
 
 		 806 aa  644    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  45.58 
 
 		 768 aa  672    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.93 
 
 		 799 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  46.65 
 
 		 843 aa  685    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  44.46 
 
 		 812 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 		 812 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.93 
 
 		 784 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 		 805 aa  638    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.06 
 
 		 784 aa  637    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  43.34 
 
 		 802 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  44.31 
 
 		 797 aa  645    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  45.24 
 
 		 817 aa  679    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  43.47 
 
 		 806 aa  646    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  42.41 
 
 		 811 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  43.95 
 
 		 785 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  44.52 
 
 		 804 aa  648    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  43.46 
 
 		 806 aa  636    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  43.3 
 
 		 785 aa  635    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 		 812 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  42.91 
 
 		 802 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  43.46 
 
 		 807 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  44.13 
 
 		 803 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  42.8 
 
 		 808 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  42.89 
 
 		 798 aa  638    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  44.97 
 
 		 814 aa  666    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  43.42 
 
 		 808 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  45.9 
 
 		 778 aa  671    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  44.14 
 
 		 802 aa  654    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  45.8 
 
 		 816 aa  680    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  44.99 
 
 		 813 aa  656    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  43.19 
 
 		 788 aa  636    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  43.12 
 
 		 810 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  52.6 
 
 		 813 aa  846    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  43.66 
 
 		 816 aa  635    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  44.65 
 
 		 836 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  43.39 
 
 		 803 aa  635    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  43.5 
 
 		 785 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  43.63 
 
 		 785 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.93 
 
 		 784 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  44.14 
 
 		 783 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  47.19 
 
 		 812 aa  709    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  46.52 
 
 		 835 aa  683    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  48.38 
 
 		 792 aa  723    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  46.3 
 
 		 828 aa  690    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0470  hypothetical protein  47.43 
 
 		 827 aa  746    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  45.91 
 
 		 800 aa  645    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  42.91 
 
 		 790 aa  651    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3640  Lon-A peptidase  44.73 
 
 		 812 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0005782  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  43.37 
 
 		 785 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  46.44 
 
 		 823 aa  698    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  42.99 
 
 		 805 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  44.26 
 
 		 785 aa  653    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  43.75 
 
 		 798 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  46.64 
 
 		 815 aa  691    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.93 
 
 		 784 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>