More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5717 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  46.84 
 
 		 816 aa  687    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  59.75 
 
 		 788 aa  897    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.9 
 
 		 784 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.9 
 
 		 784 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  47.32 
 
 		 819 aa  699    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  46.17 
 
 		 797 aa  669    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  44.46 
 
 		 820 aa  636    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  46.1 
 
 		 804 aa  656    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  46.1 
 
 		 806 aa  657    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  44.44 
 
 		 773 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  45.31 
 
 		 781 aa  654    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  44.81 
 
 		 798 aa  638    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  45.57 
 
 		 785 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.9 
 
 		 784 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  44.71 
 
 		 776 aa  649    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.71 
 
 		 776 aa  648    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.71 
 
 		 776 aa  648    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  45.43 
 
 		 815 aa  653    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  42.8 
 
 		 816 aa  635    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1823  hypothetical protein  42.8 
 
 		 816 aa  635    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  46.81 
 
 		 800 aa  664    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.9 
 
 		 784 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  45.7 
 
 		 803 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  45.76 
 
 		 784 aa  664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  45.68 
 
 		 805 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  44.94 
 
 		 802 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  46.26 
 
 		 772 aa  667    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  45.83 
 
 		 785 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3695  Lon-A peptidase  44.94 
 
 		 798 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  44.42 
 
 		 802 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  45.91 
 
 		 780 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  44.88 
 
 		 801 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  59.75 
 
 		 788 aa  897    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  47.48 
 
 		 821 aa  659    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  44.97 
 
 		 776 aa  650    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  46.09 
 
 		 774 aa  638    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  48.03 
 
 		 823 aa  699    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  48.15 
 
 		 809 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  47.47 
 
 		 816 aa  696    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  44.71 
 
 		 773 aa  649    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2097  ATP-dependent protease La  59.64 
 
 		 790 aa  920    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  44.99 
 
 		 810 aa  675    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  46.88 
 
 		 836 aa  652    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  45.13 
 
 		 768 aa  651    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  45.11 
 
 		 772 aa  648    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  51.1 
 
 		 843 aa  741    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  50.84 
 
 		 828 aa  744    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  42.61 
 
 		 778 aa  641    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  45.96 
 
 		 785 aa  659    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  48.66 
 
 		 802 aa  665    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.9 
 
 		 784 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  59.43 
 
 		 797 aa  938    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  47.87 
 
 		 823 aa  652    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  46.08 
 
 		 784 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  43.69 
 
 		 811 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  59.77 
 
 		 792 aa  914    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  47.61 
 
 		 817 aa  701    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  47.58 
 
 		 898 aa  689    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  45.16 
 
 		 783 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  45.57 
 
 		 785 aa  654    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  47.98 
 
 		 792 aa  712    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  46.09 
 
 		 785 aa  661    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  45.44 
 
 		 803 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  45.43 
 
 		 772 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  44.17 
 
 		 798 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  50.33 
 
 		 814 aa  710    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  50.84 
 
 		 835 aa  736    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  45.5 
 
 		 785 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  46.26 
 
 		 794 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  47.21 
 
 		 817 aa  701    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  45.18 
 
 		 785 aa  651    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  46.09 
 
 		 785 aa  661    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  62.45 
 
 		 786 aa  974    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  44.14 
 
 		 813 aa  681    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3752  ATP-dependent protease La  60.79 
 
 		 803 aa  937    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.728517  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5717  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 804 aa  1610    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.548129 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  44.71 
 
 		 776 aa  647    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  45.31 
 
 		 785 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  45.31 
 
 		 785 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  44.49 
 
 		 816 aa  640    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  46.51 
 
 		 783 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  45.01 
 
 		 812 aa  659    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1146  ATP-dependent protease La  59.85 
 
 		 801 aa  919    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  48.23 
 
 		 802 aa  655    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  60.23 
 
 		 810 aa  932    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  45.22 
 
 		 815 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  44.18 
 
 		 773 aa  642    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  46.97 
 
 		 790 aa  674    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  45.4 
 
 		 815 aa  664    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  45.57 
 
 		 785 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  47.14 
 
 		 823 aa  687    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  44.3 
 
 		 771 aa  635    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  45.38 
 
 		 805 aa  640    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  44.92 
 
 		 785 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  45.15 
 
 		 785 aa  636    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  47.27 
 
 		 835 aa  664    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  43.93 
 
 		 820 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  48.66 
 
 		 856 aa  703    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  44.58 
 
 		 773 aa  648    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  59.69 
 
 		 789 aa  917    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>