64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3797 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  100 
 
 		 357 aa  692    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  56.3 
 
 		 347 aa  393  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  45.22 
 
 		 348 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  46.65 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  44.94 
 
 		 348 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  43.82 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  44.67 
 
 		 373 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  41.85 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  39.89 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.5 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  42.34 
 
 		 353 aa  220  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  42.04 
 
 		 441 aa  219  6e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  40.17 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  37.39 
 
 		 342 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.23 
 
 		 348 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  39.04 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  40.12 
 
 		 316 aa  205  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  38.74 
 
 		 354 aa  202  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  36.41 
 
 		 359 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.02 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.02 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  36.59 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  42.17 
 
 		 353 aa  196  7e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  36.21 
 
 		 340 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  36.94 
 
 		 345 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.82 
 
 		 386 aa  195  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  38.61 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.02 
 
 		 353 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  39.52 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  33.8 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  39.17 
 
 		 348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.54 
 
 		 394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.53 
 
 		 376 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  34.51 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  34.62 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  30.94 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  30.94 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  31.22 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  30.66 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  30.66 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.39 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  31.22 
 
 		 340 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.75 
 
 		 338 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  31.22 
 
 		 340 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  30.11 
 
 		 345 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  30.11 
 
 		 347 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.39 
 
 		 341 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  31.96 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.48 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.4 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  42.44 
 
 		 295 aa  119  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.1 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  28.17 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  38.73 
 
 		 293 aa  109  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  29.12 
 
 		 350 aa  92.8  8e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  26.4 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  29.84 
 
 		 357 aa  87  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  25.18 
 
 		 363 aa  86.3  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  28.79 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  25.36 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  35.11 
 
 		 807 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  31.54 
 
 		 812 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  33.03 
 
 		 799 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 810 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>