More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3039 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  664    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  45.59 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  45.59 
 
 		 359 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  47.35 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  45.03 
 
 		 342 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  45.03 
 
 		 342 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  45.03 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  44.84 
 
 		 381 aa  265  8.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  44.74 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  44.73 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  45.43 
 
 		 386 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  43.1 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  40.35 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.87 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.16 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.35 
 
 		 348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  41.5 
 
 		 350 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.83 
 
 		 356 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.17 
 
 		 354 aa  206  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  43.5 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  36.13 
 
 		 347 aa  196  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  39.53 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  37.85 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.24 
 
 		 441 aa  186  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  38.05 
 
 		 358 aa  186  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  36.6 
 
 		 395 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  36.76 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  35 
 
 		 383 aa  176  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  37.04 
 
 		 355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.39 
 
 		 394 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  39.45 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  37.17 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  38.24 
 
 		 353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  34.62 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  36.67 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.14 
 
 		 376 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.99 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  32 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  31.71 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.68 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  32 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  31.43 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  31.43 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  31.43 
 
 		 345 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  31.43 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  31.43 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  31.14 
 
 		 347 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.79 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.14 
 
 		 339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.3 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  49.17 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  42.57 
 
 		 293 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.74 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  29.01 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  30.45 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  27.6 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  30.48 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  28.76 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  36.42 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  32.91 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  40.21 
 
 		 810 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  33.61 
 
 		 809 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  37.27 
 
 		 828 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  40.62 
 
 		 786 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  26.46 
 
 		 579 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  36.79 
 
 		 566 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  39.58 
 
 		 783 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  28.15 
 
 		 558 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  33.87 
 
 		 810 aa  53.5  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  31.45 
 
 		 817 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  34.23 
 
 		 788 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  39.09 
 
 		 813 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  33.94 
 
 		 802 aa  52  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  34.23 
 
 		 788 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  37.89 
 
 		 824 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 		 756 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 		 787 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3752  ATP-dependent protease La  32.23 
 
 		 803 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.728517  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1597  hypothetical protein  44.62 
 
 		 614 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000203225  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 800 aa  50.8  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.04 
 
 		 392 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  37.27 
 
 		 818 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  35.11 
 
 		 803 aa  51.2  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  32.41 
 
 		 802 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  34.21 
 
 		 789 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  34.91 
 
 		 836 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0315  hypothetical protein  43.08 
 
 		 614 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.463593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0813  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.88 
 
 		 485 aa  50.4  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  33.96 
 
 		 835 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  35.45 
 
 		 820 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1104  ATP-dependent protease LonB  33.64 
 
 		 537 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.286767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0201  ATP-dependent protease La  35.96 
 
 		 815 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  30.3 
 
 		 792 aa  50.4  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  30.4 
 
 		 815 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2097  ATP-dependent protease La  33.94 
 
 		 790 aa  50.4  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  38.46 
 
 		 807 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  38.46 
 
 		 807 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0263  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.82 
 
 		 784 aa  50.1  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  38.46 
 
 		 805 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0532  hypothetical protein  43.08 
 
 		 614 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.26777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>