More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4378 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  100 
 
 		 355 aa  706    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  45.33 
 
 		 337 aa  279  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  45.92 
 
 		 316 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.5 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.97 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  40.11 
 
 		 381 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  40.28 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.83 
 
 		 348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  39.77 
 
 		 359 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  39.71 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.11 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.33 
 
 		 342 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.33 
 
 		 342 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  40.06 
 
 		 345 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  36.94 
 
 		 348 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.4 
 
 		 348 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  37.01 
 
 		 347 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  37.54 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.74 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  38.18 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  38.4 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  35.05 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  38.11 
 
 		 373 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  34.41 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  37.83 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  33.52 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  38.32 
 
 		 387 aa  170  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  37.21 
 
 		 353 aa  169  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  33.71 
 
 		 358 aa  166  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  35.57 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.49 
 
 		 441 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  35.81 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  33.43 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.01 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  32.17 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  32.85 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.48 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.44 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  36.63 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  36.3 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  35.97 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  35.97 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  35.97 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  36.3 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  36.3 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  35.97 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  35.97 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.43 
 
 		 341 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.06 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  33.46 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  30.68 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  28.53 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.63 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  30.65 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  44.95 
 
 		 293 aa  100  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  34.57 
 
 		 295 aa  100  5e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  30.71 
 
 		 364 aa  86.7  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  26.44 
 
 		 363 aa  86.3  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  31.1 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  44.9 
 
 		 799 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 805 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  39.62 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.79 
 
 		 628 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  37.23 
 
 		 800 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  36.61 
 
 		 639 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  35.04 
 
 		 823 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  34.19 
 
 		 786 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 783 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0798  ATP-dependent protease La  40.82 
 
 		 798 aa  56.2  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.595986  normal  0.028237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  37.89 
 
 		 806 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1361  Lon-A peptidase  39.58 
 
 		 803 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0873  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.19 
 
 		 550 aa  54.3  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 		 792 aa  53.9  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  33.87 
 
 		 802 aa  54.3  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  37.89 
 
 		 818 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  34.74 
 
 		 579 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  34.78 
 
 		 650 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  36.84 
 
 		 806 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  37.23 
 
 		 670 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  32.74 
 
 		 802 aa  53.9  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  29.17 
 
 		 788 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  32.34 
 
 		 802 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  32.2 
 
 		 775 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0794  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.19 
 
 		 553 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000691143 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  31.74 
 
 		 802 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  34.74 
 
 		 809 aa  52.8  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  37.76 
 
 		 802 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  31.03 
 
 		 558 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 810 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  32.14 
 
 		 802 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  40.74 
 
 		 781 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  39.58 
 
 		 805 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  31.93 
 
 		 812 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  38.38 
 
 		 806 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1979  ATP-dependent protease La  39.18 
 
 		 859 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205373 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  36.84 
 
 		 791 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  40.21 
 
 		 804 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  38.38 
 
 		 806 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  31.25 
 
 		 648 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>