108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2750 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  100 
 
 		 387 aa  775    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  70.76 
 
 		 342 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  46.38 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  44.41 
 
 		 348 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  42.94 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  43.4 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  43.93 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  46.44 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  44.79 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  42.29 
 
 		 350 aa  262  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  45.26 
 
 		 376 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.95 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  41.59 
 
 		 353 aa  239  5.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  39.88 
 
 		 347 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.77 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  43.9 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  44.03 
 
 		 316 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.3 
 
 		 386 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  40.06 
 
 		 353 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  39.82 
 
 		 357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.75 
 
 		 354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  42.33 
 
 		 345 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.77 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  42.05 
 
 		 374 aa  210  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  38.27 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  37.75 
 
 		 345 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.75 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.75 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  42.42 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.96 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  37.43 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  35.56 
 
 		 359 aa  199  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  37.07 
 
 		 340 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  40.19 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  37.43 
 
 		 355 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  39.16 
 
 		 355 aa  176  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  54.7 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  38.5 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.12 
 
 		 341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  31.74 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  32.7 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  33.02 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  31.44 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  30.7 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  30.61 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  30.61 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  30.32 
 
 		 340 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  30.32 
 
 		 340 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.04 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.24 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.8 
 
 		 332 aa  109  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  31.33 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.57 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.21 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  29.55 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  31.01 
 
 		 358 aa  99.8  8e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  27.96 
 
 		 364 aa  87.4  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  29.18 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  32.32 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  34.94 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  36.96 
 
 		 802 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  30 
 
 		 650 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  36.96 
 
 		 802 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  33.98 
 
 		 670 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.35 
 
 		 628 aa  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  31.86 
 
 		 558 aa  49.7  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  32.38 
 
 		 652 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  28.44 
 
 		 619 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  28.44 
 
 		 619 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  27.45 
 
 		 648 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  29.71 
 
 		 799 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  32.98 
 
 		 575 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  31.87 
 
 		 802 aa  47  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  34.78 
 
 		 807 aa  46.2  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  34.62 
 
 		 812 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  34.07 
 
 		 796 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  32.26 
 
 		 772 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0315  hypothetical protein  27.83 
 
 		 614 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.463593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  32.97 
 
 		 802 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  32.32 
 
 		 808 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  35.19 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  34.72 
 
 		 655 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  34.85 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0532  hypothetical protein  27.83 
 
 		 614 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.26777  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1960  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.31 
 
 		 557 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  34.78 
 
 		 632 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  36.26 
 
 		 815 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1597  hypothetical protein  28.7 
 
 		 614 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000203225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  34.44 
 
 		 807 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  37.04 
 
 		 805 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  34.34 
 
 		 774 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  40.91 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0794  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.01 
 
 		 553 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000691143 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  32.5 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  35.44 
 
 		 805 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  32.65 
 
 		 804 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  31.43 
 
 		 570 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  31.43 
 
 		 570 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  31.96 
 
 		 806 aa  44.3  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0963  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.91 
 
 		 640 aa  43.9  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>