More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1960 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0873  peptidase S16 lon domain-containing protein  75.21 
 
 		 550 aa  738    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1960  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 		 557 aa  1105    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0794  peptidase S16, lon domain-containing protein  72.69 
 
 		 553 aa  730    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000691143 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0963  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.02 
 
 		 640 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0384  hypothetical protein  25.24 
 
 		 606 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0784776  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1597  hypothetical protein  26.16 
 
 		 614 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000203225  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0315  hypothetical protein  26.01 
 
 		 614 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.463593 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0532  hypothetical protein  25.73 
 
 		 614 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.26777  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  22.61 
 
 		 632 aa  96.3  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  32.7 
 
 		 652 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0407  ATP-dependent protease La  40.58 
 
 		 810 aa  76.6  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  36.05 
 
 		 787 aa  75.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  36.05 
 
 		 756 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.28 
 
 		 628 aa  74.7  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  34.44 
 
 		 571 aa  70.5  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1146  ATP-dependent protease La  34.39 
 
 		 801 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  32.84 
 
 		 792 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  30.77 
 
 		 797 aa  67.8  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  33.54 
 
 		 790 aa  67.4  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.12 
 
 		 786 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  35.06 
 
 		 788 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  35.06 
 
 		 788 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3246  Endopeptidase La  36.99 
 
 		 789 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171847  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  38.57 
 
 		 810 aa  65.1  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  34.29 
 
 		 804 aa  65.1  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  31.93 
 
 		 810 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  33.8 
 
 		 815 aa  64.7  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  31.89 
 
 		 802 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5717  ATP-dependent protease La  32.39 
 
 		 804 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.548129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  37.86 
 
 		 808 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  30 
 
 		 809 aa  64.3  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  31.25 
 
 		 840 aa  64.3  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5508  ATP-dependent protease La  38.51 
 
 		 835 aa  64.3  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  33.57 
 
 		 797 aa  64.3  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 		 793 aa  63.5  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  38.06 
 
 		 835 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  35.9 
 
 		 843 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  33.1 
 
 		 811 aa  63.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  38.06 
 
 		 835 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  32.81 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  35.03 
 
 		 794 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  36.43 
 
 		 789 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  34.56 
 
 		 817 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  35.21 
 
 		 794 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0599  ATP-dependent protease La  37.09 
 
 		 804 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  28.32 
 
 		 818 aa  62  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 815 aa  61.6  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0485  ATP-dependent protease La  31.48 
 
 		 830 aa  61.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0185488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4272  ATP-dependent protease La  35.17 
 
 		 775 aa  61.6  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41949  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  33.13 
 
 		 825 aa  61.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5873  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 		 785 aa  61.6  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  32.41 
 
 		 811 aa  61.2  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  29.38 
 
 		 799 aa  61.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  33.57 
 
 		 805 aa  61.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  34.03 
 
 		 815 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  31.72 
 
 		 797 aa  60.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  35.46 
 
 		 812 aa  61.2  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2742  endopeptidase La  34.44 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  31.33 
 
 		 783 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  28.92 
 
 		 650 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  39.04 
 
 		 854 aa  60.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  34.75 
 
 		 815 aa  60.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  33.57 
 
 		 815 aa  60.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  28.72 
 
 		 798 aa  60.5  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  29.41 
 
 		 826 aa  60.5  0.00000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  34.27 
 
 		 798 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  29.38 
 
 		 811 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  31.33 
 
 		 786 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  31.72 
 
 		 775 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  30.16 
 
 		 670 aa  60.1  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  29.38 
 
 		 796 aa  60.1  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  32.58 
 
 		 558 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1351  ATP-dependent protease La  37.96 
 
 		 808 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.183525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  31.94 
 
 		 805 aa  59.3  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  31.61 
 
 		 808 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.72 
 
 		 784 aa  59.7  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  29.41 
 
 		 806 aa  58.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  31.47 
 
 		 768 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  30.77 
 
 		 648 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0597  ATP-dependent protease Lon  31.87 
 
 		 635 aa  59.3  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  32.17 
 
 		 800 aa  59.3  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1042  endopeptidase La  36.49 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.384061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  34.62 
 
 		 828 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 880 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.72 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  33.56 
 
 		 936 aa  58.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  33.56 
 
 		 936 aa  58.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  32 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  32 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5222  Lon-A peptidase  37.96 
 
 		 807 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  32.89 
 
 		 802 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  31.25 
 
 		 788 aa  57.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  36.99 
 
 		 798 aa  57.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  29.48 
 
 		 801 aa  57.4  0.0000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  32 
 
 		 806 aa  57.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  32.22 
 
 		 815 aa  57.4  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  29.48 
 
 		 802 aa  57.4  0.0000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  31.61 
 
 		 812 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  30.68 
 
 		 807 aa  57.8  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  34.83 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>