More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0819 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.49 
 
 		 784 aa  650    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  44.49 
 
 		 784 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  45.96 
 
 		 768 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  45.32 
 
 		 807 aa  681    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  49.35 
 
 		 819 aa  742    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  44.62 
 
 		 798 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.62 
 
 		 784 aa  656    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  44.3 
 
 		 809 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  45.6 
 
 		 802 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  45.98 
 
 		 806 aa  661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  44.75 
 
 		 773 aa  677    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  42.49 
 
 		 816 aa  659    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1955  ATP-dependent protease La  45.13 
 
 		 805 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  44.75 
 
 		 785 aa  659    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  44.55 
 
 		 798 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  44.36 
 
 		 776 aa  674    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.62 
 
 		 776 aa  678    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.75 
 
 		 776 aa  679    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  45.13 
 
 		 805 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  43.5 
 
 		 816 aa  649    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1823  hypothetical protein  43.5 
 
 		 816 aa  648    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1749  peptidase S16, ATP-dependent protease La  44.28 
 
 		 798 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0163826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  45.47 
 
 		 810 aa  707    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  45.44 
 
 		 803 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  44.75 
 
 		 785 aa  661    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  44.25 
 
 		 805 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  44.1 
 
 		 808 aa  646    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  45.13 
 
 		 805 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  46.66 
 
 		 772 aa  702    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  44.36 
 
 		 812 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3695  Lon-A peptidase  44.94 
 
 		 798 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  45.47 
 
 		 802 aa  664    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  48.05 
 
 		 780 aa  710    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  45.55 
 
 		 801 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  44.91 
 
 		 784 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5222  Lon-A peptidase  45 
 
 		 807 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  44.8 
 
 		 805 aa  676    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  46.66 
 
 		 774 aa  661    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  48.44 
 
 		 823 aa  726    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  45.01 
 
 		 820 aa  649    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  48.17 
 
 		 809 aa  711    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2321  ATP-dependent protease La  45.13 
 
 		 805 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00784653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  44.36 
 
 		 773 aa  674    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2097  ATP-dependent protease La  75.32 
 
 		 790 aa  1202    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1230  ATP-dependent protease La  45.13 
 
 		 805 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  45.51 
 
 		 806 aa  669    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  45.87 
 
 		 768 aa  701    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  45.26 
 
 		 806 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  51.63 
 
 		 843 aa  780    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  45.05 
 
 		 812 aa  676    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  44.14 
 
 		 812 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  43.83 
 
 		 799 aa  638    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  44.93 
 
 		 802 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  61.11 
 
 		 797 aa  953    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1610  Lon-A peptidase  44.21 
 
 		 805 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000614629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  44.21 
 
 		 823 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  44.94 
 
 		 811 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  83.33 
 
 		 792 aa  1320    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2363  ATP-dependent protease La  45.13 
 
 		 805 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  44.97 
 
 		 807 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  45.01 
 
 		 783 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  43.87 
 
 		 812 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  43.73 
 
 		 802 aa  653    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  43.71 
 
 		 807 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  45.51 
 
 		 803 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0263  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.57 
 
 		 784 aa  637    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  45.86 
 
 		 798 aa  674    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  47.38 
 
 		 814 aa  698    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0427  ATP-dependent protease La  45.97 
 
 		 820 aa  644    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.272294  normal  0.22143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  44.14 
 
 		 802 aa  655    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0798  ATP-dependent protease La  45.53 
 
 		 798 aa  642    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.595986  normal  0.028237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6158  ATP-dependent protease La  45.13 
 
 		 807 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  44.34 
 
 		 788 aa  655    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  44.28 
 
 		 798 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  44.97 
 
 		 813 aa  687    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  41.48 
 
 		 776 aa  635    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  44.62 
 
 		 785 aa  659    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  44.02 
 
 		 803 aa  655    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  44.62 
 
 		 785 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  44.62 
 
 		 785 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  45.13 
 
 		 816 aa  663    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  45.01 
 
 		 783 aa  667    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  45.07 
 
 		 812 aa  685    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  43.76 
 
 		 802 aa  636    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1909  ATP-dependent protease La  45 
 
 		 807 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  44.3 
 
 		 798 aa  648    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1921  ATP-dependent protease La  45.13 
 
 		 807 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  43.23 
 
 		 815 aa  639    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  47.79 
 
 		 790 aa  706    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3640  Lon-A peptidase  44.04 
 
 		 812 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0005782  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  44.75 
 
 		 785 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  46.66 
 
 		 823 aa  698    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  43.44 
 
 		 771 aa  637    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  45 
 
 		 805 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  45.49 
 
 		 785 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  44.88 
 
 		 785 aa  656    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  45.08 
 
 		 815 aa  703    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  43.14 
 
 		 817 aa  660    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  46.97 
 
 		 856 aa  681    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3350  ATP-dependent protease La  45.13 
 
 		 805 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>