More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7929 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 356 aa  717    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  45.66 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  45.43 
 
 		 348 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  44.82 
 
 		 348 aa  272  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.34 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  43.1 
 
 		 337 aa  249  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  42.17 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  42.54 
 
 		 353 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  42.25 
 
 		 345 aa  235  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  40.97 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.71 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  42.94 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  41.09 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.46 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  40.92 
 
 		 353 aa  222  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.83 
 
 		 342 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.83 
 
 		 342 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  38.87 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  39.55 
 
 		 345 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  38.5 
 
 		 357 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.9 
 
 		 441 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  38.2 
 
 		 381 aa  215  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  38.38 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  39.88 
 
 		 348 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  39.83 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  39.07 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  37.76 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  38.46 
 
 		 373 aa  203  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  39.66 
 
 		 340 aa  202  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  38.75 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  38.68 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  40 
 
 		 387 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  39.29 
 
 		 374 aa  189  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  36.12 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.26 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  34.93 
 
 		 353 aa  169  6e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.49 
 
 		 338 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.66 
 
 		 341 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  33.85 
 
 		 340 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  34.05 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  33.74 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  33.74 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  33.74 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  33.44 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  33.44 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  34.15 
 
 		 345 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  33.85 
 
 		 347 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.77 
 
 		 339 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.82 
 
 		 332 aa  133  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  54.63 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.79 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  55.56 
 
 		 293 aa  123  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.47 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  35.56 
 
 		 358 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  28.81 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  28.83 
 
 		 357 aa  99.8  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  29.43 
 
 		 364 aa  99.4  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  32.17 
 
 		 336 aa  96.7  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  33.8 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  28.93 
 
 		 363 aa  93.2  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  35.11 
 
 		 810 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  36.96 
 
 		 570 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2174  serine protease  37.18 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00156367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  36.56 
 
 		 783 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  36.56 
 
 		 786 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 812 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  36.46 
 
 		 788 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  34.62 
 
 		 652 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  35.87 
 
 		 570 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  36.71 
 
 		 807 aa  53.9  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  38.14 
 
 		 818 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  41.77 
 
 		 805 aa  53.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  34.02 
 
 		 932 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  40.58 
 
 		 810 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  44.29 
 
 		 775 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 791 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  37.11 
 
 		 804 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  39.24 
 
 		 815 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  34.62 
 
 		 815 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  38.3 
 
 		 780 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  37.63 
 
 		 801 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  34.41 
 
 		 800 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  42.25 
 
 		 835 aa  51.2  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  43.84 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  39.24 
 
 		 779 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  35.11 
 
 		 791 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  40.91 
 
 		 796 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 806 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  37.11 
 
 		 826 aa  51.2  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  37.63 
 
 		 802 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  36.71 
 
 		 800 aa  50.8  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  30.56 
 
 		 670 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  33.64 
 
 		 824 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  36.08 
 
 		 813 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  35.11 
 
 		 791 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  41.77 
 
 		 802 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  31.91 
 
 		 809 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  33.68 
 
 		 801 aa  50.4  0.00005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  33.68 
 
 		 802 aa  50.4  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1873  secreted protein containing a PDZ domain  26.77 
 
 		 340 aa  50.4  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>