146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2889 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  100 
 
 		 373 aa  721    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  56.64 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  51.94 
 
 		 441 aa  342  7e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  54.39 
 
 		 353 aa  327  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  52.51 
 
 		 358 aa  317  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  45.64 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  43.02 
 
 		 348 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  44.57 
 
 		 387 aa  255  9e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  44.85 
 
 		 376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  42.33 
 
 		 383 aa  243  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  37.89 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  44.67 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  45.69 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  38.68 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  45.03 
 
 		 316 aa  219  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  42.06 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  41.83 
 
 		 353 aa  212  9e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  42.12 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.23 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  37.39 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.46 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.14 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.14 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.02 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  39.27 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  36.95 
 
 		 342 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  36.95 
 
 		 342 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  36.95 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  40.91 
 
 		 345 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.96 
 
 		 386 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  36.08 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  40.42 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  34.32 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  33.43 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  36.68 
 
 		 355 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  34.97 
 
 		 355 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  59.17 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  54.76 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.14 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  31.84 
 
 		 340 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  31.48 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  31.84 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  31.56 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  31.84 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  31.56 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  31.84 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.1 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  30.85 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  30.3 
 
 		 347 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.43 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.95 
 
 		 338 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.45 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  28.89 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.19 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  33.18 
 
 		 358 aa  89.7  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  26.92 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  25.23 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  28.49 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  23.1 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  30.34 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  29.92 
 
 		 619 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  29.92 
 
 		 619 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  34.12 
 
 		 456 aa  50.4  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  35.58 
 
 		 810 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  43.04 
 
 		 805 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  36.08 
 
 		 652 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1487  peptidase S16, Lon-like protease  38.98 
 
 		 693 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  39.56 
 
 		 799 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  37.97 
 
 		 792 aa  47.4  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  35.16 
 
 		 809 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  29.59 
 
 		 812 aa  47  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  40.48 
 
 		 816 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  43.28 
 
 		 802 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  28.44 
 
 		 650 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  32.99 
 
 		 774 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  34.69 
 
 		 771 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  40.48 
 
 		 783 aa  46.6  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  43.28 
 
 		 802 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  34.12 
 
 		 455 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  34.58 
 
 		 786 aa  46.2  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  38.36 
 
 		 471 aa  46.2  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  34.12 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  34.41 
 
 		 801 aa  45.8  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  38.27 
 
 		 803 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  31.52 
 
 		 670 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  39.29 
 
 		 809 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0404  Lon-B peptidase  37.29 
 
 		 692 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.175581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 772 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1979  ATP-dependent protease La  37.23 
 
 		 859 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205373 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  32.94 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  37.97 
 
 		 794 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  35.35 
 
 		 772 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  37.97 
 
 		 794 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  35.79 
 
 		 826 aa  45.1  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  34.41 
 
 		 802 aa  45.4  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  40.48 
 
 		 809 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  35.16 
 
 		 788 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  33.02 
 
 		 785 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0433  peptidase S16, Lon-like protease  32.69 
 
 		 692 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.317598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  38.37 
 
 		 808 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>