More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1432 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  99.71 
 
 		 345 aa  681    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 342 aa  684    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 342 aa  684    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  73.68 
 
 		 359 aa  521  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  72.51 
 
 		 340 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  70.47 
 
 		 340 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  46.49 
 
 		 337 aa  299  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  47.08 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  46.79 
 
 		 353 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  45.03 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  46.25 
 
 		 316 aa  272  8.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  49.25 
 
 		 355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  45.45 
 
 		 338 aa  252  6e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  42.57 
 
 		 348 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  42.57 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  41.88 
 
 		 348 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.67 
 
 		 394 aa  222  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  40.54 
 
 		 348 aa  222  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.83 
 
 		 348 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  39.83 
 
 		 356 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  38.69 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  37.78 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  35.84 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  39.84 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  37.72 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  36.05 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  37.75 
 
 		 387 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.14 
 
 		 441 aa  186  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  39.88 
 
 		 353 aa  186  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.29 
 
 		 376 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  36.95 
 
 		 373 aa  185  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  36.9 
 
 		 357 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  35.95 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  37.04 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.38 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  33.44 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.18 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  31.74 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  31.93 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  31.74 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  31.44 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  31.44 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  31.44 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  31.44 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  31.44 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  31.44 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.44 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.29 
 
 		 337 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.45 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.84 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  50.43 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  33.89 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.98 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  34.9 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  36.87 
 
 		 295 aa  104  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  30.74 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  28.96 
 
 		 358 aa  93.2  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  26.98 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  35.76 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  29.31 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  37.23 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  34.86 
 
 		 670 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.59 
 
 		 628 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  38.71 
 
 		 799 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  31.68 
 
 		 788 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  32.29 
 
 		 650 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2310  ATP-dependent protease La  36.84 
 
 		 769 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  37.63 
 
 		 932 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  38.71 
 
 		 818 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  34.41 
 
 		 783 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  35.16 
 
 		 802 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  32.32 
 
 		 558 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  39.47 
 
 		 812 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  34.41 
 
 		 786 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  39.47 
 
 		 815 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  34.41 
 
 		 802 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  33.33 
 
 		 570 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  28.15 
 
 		 809 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  32.61 
 
 		 579 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  34.04 
 
 		 806 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  34.04 
 
 		 801 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  40.24 
 
 		 815 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  37.21 
 
 		 806 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  35.11 
 
 		 805 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  35.11 
 
 		 774 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  35.48 
 
 		 813 aa  50.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 816 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  37.88 
 
 		 632 aa  50.1  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0764  ATP-dependent protease La  33.73 
 
 		 774 aa  50.1  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 808 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  39.76 
 
 		 819 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  32.26 
 
 		 810 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  38.16 
 
 		 803 aa  49.7  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  40.3 
 
 		 655 aa  49.7  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  31.18 
 
 		 570 aa  49.7  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3640  Lon-A peptidase  34.04 
 
 		 812 aa  49.7  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0005782  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  29.67 
 
 		 648 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  38.89 
 
 		 816 aa  49.3  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  32.38 
 
 		 817 aa  49.3  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 820 aa  49.3  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>