More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2463 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 441 aa  845    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  55.14 
 
 		 395 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  51.94 
 
 		 373 aa  342  9e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  49.72 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  52.87 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  43.92 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  40.46 
 
 		 348 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  42.48 
 
 		 342 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  43.68 
 
 		 383 aa  244  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  44.19 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  40.56 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  42.04 
 
 		 357 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  38.44 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.9 
 
 		 356 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  43.15 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  37.54 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  41.6 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.6 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  42.15 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  41.67 
 
 		 353 aa  207  4e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.12 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  42.36 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.98 
 
 		 353 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  39.65 
 
 		 345 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.59 
 
 		 394 aa  192  7e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.51 
 
 		 386 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  37.46 
 
 		 340 aa  186  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.14 
 
 		 342 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.14 
 
 		 342 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  39.63 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  37.95 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  41.09 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  35.63 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  34.44 
 
 		 359 aa  172  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  33.73 
 
 		 355 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  59.17 
 
 		 295 aa  152  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  35.92 
 
 		 355 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.01 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  54.69 
 
 		 293 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.7 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  30.12 
 
 		 340 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  30.41 
 
 		 340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  29.82 
 
 		 340 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  29.82 
 
 		 340 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  30.12 
 
 		 340 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  30.12 
 
 		 340 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  30.41 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  29.77 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  29.77 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.55 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.86 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.35 
 
 		 341 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  28.75 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  29.11 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  29.9 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  28.41 
 
 		 363 aa  79.7  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  31.58 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  24.44 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  31.13 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  35.16 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  35.16 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  35.64 
 
 		 812 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  31.15 
 
 		 932 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0485  ATP-dependent protease La  39.24 
 
 		 830 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0185488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  35.29 
 
 		 780 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  31.03 
 
 		 476 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  38.54 
 
 		 771 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  35.56 
 
 		 815 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  37.23 
 
 		 853 aa  51.6  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  32.95 
 
 		 798 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  30.73 
 
 		 388 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  32.14 
 
 		 775 aa  51.2  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  30.73 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  35 
 
 		 802 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  30.73 
 
 		 402 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  35.51 
 
 		 652 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  30.73 
 
 		 402 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  30.73 
 
 		 402 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  33.61 
 
 		 802 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  37.36 
 
 		 810 aa  50.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 802 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  35.29 
 
 		 816 aa  50.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5508  ATP-dependent protease La  34.64 
 
 		 835 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  31.78 
 
 		 402 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  34.48 
 
 		 809 aa  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  30.73 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  40.85 
 
 		 807 aa  50.1  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  31.01 
 
 		 401 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  32.14 
 
 		 809 aa  50.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.01 
 
 		 401 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  34.4 
 
 		 797 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  33.86 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  30.36 
 
 		 801 aa  49.7  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  32.33 
 
 		 797 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  34.04 
 
 		 840 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  30.36 
 
 		 802 aa  49.3  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  38.64 
 
 		 820 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  38.46 
 
 		 811 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  29.51 
 
 		 798 aa  49.7  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>