More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1252 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  41.94 
 
 		 1104 aa  647    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  44.76 
 
 		 882 aa  674    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  51.25 
 
 		 819 aa  796    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  63.94 
 
 		 805 aa  1033    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  63.94 
 
 		 805 aa  1035    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  66.28 
 
 		 799 aa  1053    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  46.3 
 
 		 791 aa  687    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  44.89 
 
 		 936 aa  681    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  56.47 
 
 		 800 aa  893    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  64.98 
 
 		 808 aa  1046    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  62.78 
 
 		 805 aa  1019    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  64.98 
 
 		 800 aa  1042    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  63.04 
 
 		 805 aa  1020    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  100 
 
 		 797 aa  1616    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  44.89 
 
 		 936 aa  681    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  64.59 
 
 		 805 aa  1041    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  63.39 
 
 		 807 aa  1030    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  55.08 
 
 		 814 aa  895    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  42.58 
 
 		 817 aa  639    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  62.3 
 
 		 853 aa  1023    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  64.73 
 
 		 815 aa  1046    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  64.12 
 
 		 816 aa  1034    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  56.3 
 
 		 800 aa  889    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  46.42 
 
 		 825 aa  703    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  65.21 
 
 		 798 aa  1042    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  60.74 
 
 		 812 aa  969    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  66.54 
 
 		 799 aa  1055    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  58.09 
 
 		 809 aa  908    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  43.81 
 
 		 792 aa  632  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  42.19 
 
 		 778 aa  624  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  42.73 
 
 		 816 aa  617  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  43.29 
 
 		 797 aa  613  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  41.93 
 
 		 806 aa  612  9.999999999999999e-175  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  43.14 
 
 		 806 aa  612  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  44.13 
 
 		 768 aa  609  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  44.12 
 
 		 806 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  42.99 
 
 		 867 aa  607  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  43.69 
 
 		 805 aa  608  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  43.4 
 
 		 840 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  42.23 
 
 		 804 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  42.95 
 
 		 812 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  42.36 
 
 		 810 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 		 797 aa  605  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  41.94 
 
 		 880 aa  601  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  41.49 
 
 		 802 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  41.75 
 
 		 802 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  42.58 
 
 		 813 aa  598  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  41.82 
 
 		 817 aa  601  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  42.69 
 
 		 812 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  42.97 
 
 		 814 aa  597  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  42.24 
 
 		 805 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  42.47 
 
 		 819 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  41.81 
 
 		 783 aa  592  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  42.2 
 
 		 796 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  45.1 
 
 		 1309 aa  595  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  41.84 
 
 		 805 aa  592  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  42.08 
 
 		 823 aa  595  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  41.43 
 
 		 817 aa  592  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  42.2 
 
 		 811 aa  592  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  41.6 
 
 		 802 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  41.69 
 
 		 816 aa  595  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  42.24 
 
 		 805 aa  595  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  40.77 
 
 		 820 aa  595  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  42.22 
 
 		 815 aa  594  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  40.96 
 
 		 775 aa  590  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  42.03 
 
 		 816 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1823  hypothetical protein  42.03 
 
 		 816 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  42.29 
 
 		 807 aa  589  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  42.54 
 
 		 810 aa  590  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  41.62 
 
 		 809 aa  590  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  42.42 
 
 		 825 aa  589  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  42.52 
 
 		 812 aa  590  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  41.76 
 
 		 807 aa  589  1e-167  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  42.02 
 
 		 806 aa  591  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  41.71 
 
 		 804 aa  591  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  42.04 
 
 		 776 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  42.16 
 
 		 810 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.63 
 
 		 793 aa  586  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.89 
 
 		 784 aa  586  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.76 
 
 		 793 aa  587  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.78 
 
 		 787 aa  588  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  41.96 
 
 		 856 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  42.03 
 
 		 808 aa  588  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  42.4 
 
 		 780 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  40.64 
 
 		 835 aa  588  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.81 
 
 		 784 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  41.73 
 
 		 846 aa  588  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  41.75 
 
 		 818 aa  587  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  41.93 
 
 		 776 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.99 
 
 		 784 aa  588  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  43.21 
 
 		 815 aa  587  1e-166  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  41.49 
 
 		 807 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  41.49 
 
 		 808 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  42.01 
 
 		 806 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  42.1 
 
 		 806 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  41.75 
 
 		 806 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.76 
 
 		 786 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.68 
 
 		 784 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.55 
 
 		 784 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  41.93 
 
 		 812 aa  585  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>