More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1535 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  40.74 
 
 
1104 aa  642    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  45.79 
 
 
799 aa  695    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  43.76 
 
 
798 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  46.01 
 
 
819 aa  726    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  41.4 
 
 
815 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  43.57 
 
 
804 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  45.62 
 
 
819 aa  653    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  46 
 
 
805 aa  683    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  43.61 
 
 
798 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  42.34 
 
 
815 aa  643    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  54.51 
 
 
791 aa  853    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  43.43 
 
 
806 aa  653    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  45.08 
 
 
797 aa  687    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.08 
 
 
786 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  46.3 
 
 
798 aa  692    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  45.47 
 
 
808 aa  689    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  43.96 
 
 
805 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  49.45 
 
 
800 aa  778    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  42.49 
 
 
807 aa  654    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  43.19 
 
 
806 aa  639    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  46.99 
 
 
797 aa  671    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  43.49 
 
 
816 aa  645    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1823  hypothetical protein  43.37 
 
 
816 aa  642    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0469  ATP-dependent protease La  42.84 
 
 
823 aa  636    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  43.96 
 
 
805 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1904  ATP-dependent protease La  43.61 
 
 
798 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798335  hitchhiker  0.000618765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  43.65 
 
 
804 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  47.14 
 
 
797 aa  704    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  44.68 
 
 
783 aa  637    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  43.58 
 
 
806 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  42.63 
 
 
816 aa  640    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  44.39 
 
 
807 aa  681    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  43.32 
 
 
802 aa  640    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  50.62 
 
 
814 aa  782    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  43.06 
 
 
801 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  43.66 
 
 
828 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  44.25 
 
 
806 aa  669    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  43.57 
 
 
804 aa  654    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  43.47 
 
 
810 aa  671    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  44.18 
 
 
823 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  46.75 
 
 
806 aa  711    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  46.22 
 
 
809 aa  656    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  42.52 
 
 
856 aa  652    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  46.08 
 
 
853 aa  698    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  43.02 
 
 
820 aa  639    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  43.44 
 
 
803 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  43.67 
 
 
768 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  43.24 
 
 
805 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  46.18 
 
 
800 aa  646    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  44.01 
 
 
812 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  43.46 
 
 
821 aa  635    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  45.21 
 
 
805 aa  690    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  47.87 
 
 
812 aa  690    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  41.79 
 
 
836 aa  648    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  43.13 
 
 
811 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  46.68 
 
 
816 aa  718    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  43.39 
 
 
810 aa  635    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  44.52 
 
 
880 aa  683    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  45.39 
 
 
817 aa  674    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  44.14 
 
 
812 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  43.19 
 
 
806 aa  638    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  45.93 
 
 
815 aa  704    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  44.66 
 
 
810 aa  651    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  45.45 
 
 
800 aa  679    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  42.77 
 
 
820 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  43.42 
 
 
814 aa  638    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  49.32 
 
 
800 aa  774    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1744  ATP-dependent protease La  43.61 
 
 
798 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484284  hitchhiker  0.00114156 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  43.52 
 
 
813 aa  642    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  43.27 
 
 
817 aa  641    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  42.57 
 
 
835 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  46 
 
 
805 aa  683    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  44.27 
 
 
798 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  43.25 
 
 
817 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  42.6 
 
 
811 aa  647    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  47.71 
 
 
815 aa  695    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  42.75 
 
 
825 aa  640    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  44.93 
 
 
792 aa  668    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  46.43 
 
 
825 aa  657    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  44.44 
 
 
882 aa  655    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  44.4 
 
 
798 aa  653    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  46.62 
 
 
799 aa  696    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  44.09 
 
 
805 aa  680    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  46.98 
 
 
809 aa  705    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  100 
 
 
825 aa  1669    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  44.5 
 
 
775 aa  671    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  42.6 
 
 
796 aa  647    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1211  ATP-dependent protease La  44.19 
 
 
817 aa  635    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  46.68 
 
 
778 aa  686    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  46.18 
 
 
898 aa  659    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3467  ATP-dependent protease La  43.61 
 
 
798 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.895403  hitchhiker  0.000510926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  43.5 
 
 
807 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  42.41 
 
 
805 aa  632  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  43.62 
 
 
808 aa  634  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  46.2 
 
 
807 aa  634  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  42.91 
 
 
802 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  43.3 
 
 
806 aa  635  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  43.5 
 
 
806 aa  635  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0754  ATP-dependent endopeptidase Lon  44.07 
 
 
817 aa  632  1e-180  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.261769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  43.59 
 
 
773 aa  632  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>