More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0534 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  46.58 
 
 		 1104 aa  639    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  55.22 
 
 		 800 aa  895    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  49.14 
 
 		 819 aa  785    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  55.51 
 
 		 805 aa  894    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  46.9 
 
 		 791 aa  688    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  56.27 
 
 		 798 aa  887    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  54.5 
 
 		 805 aa  895    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  54.5 
 
 		 805 aa  895    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  44.37 
 
 		 775 aa  637    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  58.21 
 
 		 797 aa  913    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  55.76 
 
 		 805 aa  898    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  55.15 
 
 		 807 aa  884    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  52.33 
 
 		 814 aa  849    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  57.14 
 
 		 799 aa  909    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  46.67 
 
 		 825 aa  708    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  56.31 
 
 		 853 aa  888    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  55.71 
 
 		 808 aa  895    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  44.64 
 
 		 882 aa  674    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  52.42 
 
 		 800 aa  835    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  48.72 
 
 		 936 aa  701    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  52.3 
 
 		 800 aa  835    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  55.03 
 
 		 812 aa  844    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  54.63 
 
 		 815 aa  901    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  58.12 
 
 		 816 aa  922    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  55.76 
 
 		 805 aa  896    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  48.72 
 
 		 936 aa  701    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  57.4 
 
 		 799 aa  909    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  100 
 
 		 809 aa  1637    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  44.29 
 
 		 817 aa  632  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  43.64 
 
 		 806 aa  634  1e-180  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  44.53 
 
 		 792 aa  627  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  43.7 
 
 		 807 aa  625  1e-177  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  44.17 
 
 		 815 aa  619  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  43.97 
 
 		 778 aa  618  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  45.04 
 
 		 800 aa  616  1e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  44.09 
 
 		 788 aa  613  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  43.09 
 
 		 812 aa  610  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  43.58 
 
 		 806 aa  611  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  43.16 
 
 		 880 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  43.4 
 
 		 825 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  42.75 
 
 		 810 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  42.73 
 
 		 840 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  42.6 
 
 		 815 aa  602  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  43.35 
 
 		 817 aa  603  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  41.98 
 
 		 815 aa  600  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  42.91 
 
 		 805 aa  600  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  43.47 
 
 		 823 aa  598  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  42.38 
 
 		 817 aa  599  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  43.13 
 
 		 804 aa  599  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  43.51 
 
 		 812 aa  600  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  42.8 
 
 		 856 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  43.24 
 
 		 819 aa  598  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  43.86 
 
 		 805 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  42.99 
 
 		 797 aa  596  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  43.78 
 
 		 768 aa  598  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  42.39 
 
 		 775 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  42.51 
 
 		 774 aa  598  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  42.88 
 
 		 783 aa  596  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  42.69 
 
 		 797 aa  596  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  43.32 
 
 		 835 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  42.73 
 
 		 776 aa  594  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  42.68 
 
 		 802 aa  593  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  44.06 
 
 		 828 aa  595  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  42.11 
 
 		 779 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  43.16 
 
 		 802 aa  594  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2218  Lon-A peptidase  44.91 
 
 		 819 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  43.77 
 
 		 836 aa  592  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  43.8 
 
 		 815 aa  593  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0485  ATP-dependent protease La  41.51 
 
 		 830 aa  594  1e-168  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0185488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  42.07 
 
 		 773 aa  589  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  42.46 
 
 		 776 aa  589  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  42.46 
 
 		 776 aa  590  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  42.46 
 
 		 776 aa  590  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  42.46 
 
 		 776 aa  591  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  42.46 
 
 		 773 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  41.11 
 
 		 816 aa  590  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  44.43 
 
 		 843 aa  592  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  44.26 
 
 		 835 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  42.51 
 
 		 776 aa  589  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  42.67 
 
 		 808 aa  591  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  42.75 
 
 		 776 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  44.26 
 
 		 835 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  40.12 
 
 		 846 aa  592  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  42.25 
 
 		 773 aa  588  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  41.98 
 
 		 773 aa  588  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  42.67 
 
 		 780 aa  588  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  41.06 
 
 		 825 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  42.33 
 
 		 798 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  44.52 
 
 		 814 aa  587  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  42.17 
 
 		 817 aa  587  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  42.05 
 
 		 802 aa  587  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  43.06 
 
 		 820 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  42.8 
 
 		 817 aa  587  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  44.95 
 
 		 821 aa  588  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  42.8 
 
 		 816 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  43.44 
 
 		 772 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  39.33 
 
 		 820 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.53 
 
 		 784 aa  585  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  41.6 
 
 		 804 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  42.93 
 
 		 810 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>