More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0591 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  47.67 
 
 		 1104 aa  676    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  52.6 
 
 		 800 aa  817    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  43.47 
 
 		 797 aa  640    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  51.15 
 
 		 819 aa  819    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  44.06 
 
 		 812 aa  645    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  44.47 
 
 		 819 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  52.04 
 
 		 805 aa  827    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  45.87 
 
 		 835 aa  644    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  46.94 
 
 		 791 aa  736    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  44.22 
 
 		 816 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  44.42 
 
 		 797 aa  646    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  43.81 
 
 		 773 aa  650    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  44.83 
 
 		 778 aa  660    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  43.94 
 
 		 776 aa  651    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  52.08 
 
 		 805 aa  819    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  44.01 
 
 		 776 aa  649    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.14 
 
 		 776 aa  651    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  43.94 
 
 		 776 aa  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  52.16 
 
 		 805 aa  831    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  45.09 
 
 		 775 aa  650    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  44.14 
 
 		 776 aa  651    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  44.77 
 
 		 880 aa  671    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  52.02 
 
 		 805 aa  817    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  43.54 
 
 		 835 aa  637    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  45.18 
 
 		 800 aa  650    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  56.17 
 
 		 797 aa  884    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  46.52 
 
 		 936 aa  714    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  44.68 
 
 		 808 aa  635    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  44.86 
 
 		 825 aa  657    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  53.62 
 
 		 799 aa  846    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  52.96 
 
 		 808 aa  835    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  53.17 
 
 		 807 aa  834    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  44.62 
 
 		 802 aa  636    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  43.67 
 
 		 780 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  100 
 
 		 814 aa  1660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  45.71 
 
 		 772 aa  639    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  43.88 
 
 		 776 aa  645    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  52.73 
 
 		 812 aa  830    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  42.64 
 
 		 846 aa  636    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  44.44 
 
 		 823 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  45.87 
 
 		 835 aa  643    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  45.19 
 
 		 809 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  45 
 
 		 802 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  54.11 
 
 		 853 aa  840    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  44.01 
 
 		 773 aa  649    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  45.57 
 
 		 774 aa  660    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  44.2 
 
 		 773 aa  642    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  46.04 
 
 		 828 aa  655    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  44.42 
 
 		 805 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  46.12 
 
 		 843 aa  648    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  44.37 
 
 		 833 aa  656    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  44.53 
 
 		 812 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  46.52 
 
 		 936 aa  714    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  42.41 
 
 		 810 aa  643    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  44.34 
 
 		 817 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  52.66 
 
 		 805 aa  835    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  53.26 
 
 		 798 aa  832    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  44.88 
 
 		 815 aa  661    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  45.22 
 
 		 813 aa  651    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  44.53 
 
 		 812 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  43.75 
 
 		 773 aa  645    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  53.17 
 
 		 815 aa  838    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  75.32 
 
 		 800 aa  1244    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  46.92 
 
 		 817 aa  692    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  44.84 
 
 		 775 aa  658    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  46.6 
 
 		 840 aa  668    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  44.81 
 
 		 814 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  44.77 
 
 		 806 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  45.05 
 
 		 807 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  46.74 
 
 		 810 aa  659    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  45.62 
 
 		 856 aa  660    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  74.81 
 
 		 800 aa  1237    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  44.34 
 
 		 776 aa  653    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  44.34 
 
 		 776 aa  652    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  45.01 
 
 		 882 aa  721    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.77 
 
 		 786 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  45.27 
 
 		 816 aa  658    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  47.61 
 
 		 805 aa  699    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  44.42 
 
 		 805 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  54.12 
 
 		 799 aa  852    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  44.99 
 
 		 817 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  43.88 
 
 		 776 aa  644    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  51 
 
 		 825 aa  769    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  52.33 
 
 		 809 aa  835    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  46.25 
 
 		 792 aa  691    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  44.52 
 
 		 823 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  46.9 
 
 		 898 aa  656    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  52.29 
 
 		 816 aa  842    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  44.14 
 
 		 810 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  43.9 
 
 		 810 aa  632  1e-180  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  43.47 
 
 		 836 aa  632  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  43.53 
 
 		 806 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  42.28 
 
 		 867 aa  634  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  45.56 
 
 		 797 aa  633  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  42.67 
 
 		 829 aa  633  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  42.21 
 
 		 837 aa  632  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  44.22 
 
 		 802 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  42.16 
 
 		 820 aa  635  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  44.53 
 
 		 771 aa  634  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  43.33 
 
 		 818 aa  629  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>