More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2665 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  66.08 
 
 
808 aa  1098    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  50.19 
 
 
819 aa  771    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  67.09 
 
 
805 aa  1095    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  45.27 
 
 
791 aa  671    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  64.63 
 
 
805 aa  1077    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  43.54 
 
 
792 aa  635    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  64.87 
 
 
805 aa  1082    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  65.34 
 
 
797 aa  1032    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  50.07 
 
 
936 aa  666    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  65.59 
 
 
807 aa  1094    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  53.17 
 
 
814 aa  838    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  60.13 
 
 
853 aa  968    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  67.22 
 
 
805 aa  1098    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  45.79 
 
 
882 aa  677    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  62.08 
 
 
812 aa  1009    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  67.09 
 
 
799 aa  1101    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  67.18 
 
 
800 aa  1095    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  100 
 
 
815 aa  1662    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  65.38 
 
 
816 aa  1096    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  50.07 
 
 
936 aa  666    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  66.96 
 
 
805 aa  1093    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  45.48 
 
 
825 aa  693    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  53.01 
 
 
800 aa  841    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  68.49 
 
 
798 aa  1106    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  67.73 
 
 
799 aa  1107    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  52.4 
 
 
800 aa  835    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  54.63 
 
 
809 aa  890    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  45.78 
 
 
1104 aa  634  1e-180  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  43.56 
 
 
817 aa  631  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  43.22 
 
 
778 aa  621  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  43.91 
 
 
775 aa  617  1e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  40.59 
 
 
806 aa  608  9.999999999999999e-173  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  42.89 
 
 
816 aa  603  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  43.04 
 
 
880 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  43.85 
 
 
800 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  42.11 
 
 
776 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  41.98 
 
 
776 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  43.57 
 
 
805 aa  599  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  43.21 
 
 
840 aa  599  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  42.89 
 
 
806 aa  598  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  40.75 
 
 
823 aa  597  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  41.01 
 
 
817 aa  595  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  42.75 
 
 
804 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  42.26 
 
 
856 aa  589  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  41.85 
 
 
846 aa  589  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  42.43 
 
 
805 aa  592  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  41.47 
 
 
817 aa  590  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  42.55 
 
 
788 aa  590  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  41.63 
 
 
807 aa  589  1e-167  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  42.12 
 
 
819 aa  585  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  40.65 
 
 
776 aa  586  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  42.41 
 
 
836 aa  588  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  43.01 
 
 
812 aa  587  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  41.9 
 
 
809 aa  587  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  41.54 
 
 
815 aa  585  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  41.56 
 
 
833 aa  586  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  41.47 
 
 
816 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  42.43 
 
 
806 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  40.65 
 
 
773 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  42.91 
 
 
812 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  40.52 
 
 
776 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  41.18 
 
 
810 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  40.65 
 
 
776 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  41.86 
 
 
802 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  40.65 
 
 
807 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  39.82 
 
 
816 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  42.19 
 
 
802 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  41.91 
 
 
780 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  40.65 
 
 
776 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  40.52 
 
 
773 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  42.89 
 
 
772 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  40.65 
 
 
776 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  41.85 
 
 
835 aa  581  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  40.65 
 
 
804 aa  579  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  40.26 
 
 
773 aa  580  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  41.7 
 
 
810 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  40.8 
 
 
806 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  40.26 
 
 
776 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  41.62 
 
 
867 aa  581  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  41.14 
 
 
823 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  42.43 
 
 
808 aa  579  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  41.91 
 
 
797 aa  579  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  41.96 
 
 
825 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  42.1 
 
 
814 aa  579  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  41.68 
 
 
802 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  42.23 
 
 
775 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  41.18 
 
 
774 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.18 
 
 
784 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.06 
 
 
784 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  41.56 
 
 
812 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  40.13 
 
 
776 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.18 
 
 
784 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  42.15 
 
 
768 aa  578  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  41.31 
 
 
812 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  41.31 
 
 
812 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  41.17 
 
 
802 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  40.95 
 
 
898 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  42.3 
 
 
806 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  42.02 
 
 
802 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  42 
 
 
785 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>