More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0623  Lon family protease  50.57 
 
 		 819 aa  773    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  46.04 
 
 		 825 aa  688    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  84.1 
 
 		 805 aa  1389    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  52.66 
 
 		 936 aa  674    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  45.45 
 
 		 791 aa  654    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  84.1 
 
 		 805 aa  1395    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  83.85 
 
 		 805 aa  1392    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  67.02 
 
 		 797 aa  1045    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  64.01 
 
 		 812 aa  1015    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  85.62 
 
 		 807 aa  1411    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  53.74 
 
 		 800 aa  850    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  54.12 
 
 		 814 aa  852    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  52.66 
 
 		 936 aa  674    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  84.6 
 
 		 805 aa  1390    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  60.52 
 
 		 853 aa  965    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  86.22 
 
 		 800 aa  1407    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  84.72 
 
 		 805 aa  1397    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  85.32 
 
 		 808 aa  1401    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  67.73 
 
 		 815 aa  1107    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  44.07 
 
 		 882 aa  643    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  98.75 
 
 		 799 aa  1599    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  100 
 
 		 799 aa  1615    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  57.4 
 
 		 809 aa  894    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  86.84 
 
 		 798 aa  1417    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  68.21 
 
 		 816 aa  1122    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  53.87 
 
 		 800 aa  850    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  46.19 
 
 		 1104 aa  624  1e-177  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  44.55 
 
 		 778 aa  625  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  42.8 
 
 		 817 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  41.71 
 
 		 806 aa  615  9.999999999999999e-175  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  43.04 
 
 		 806 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  42.36 
 
 		 775 aa  601  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  42.88 
 
 		 806 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  41 
 
 		 880 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  41.89 
 
 		 776 aa  598  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  41.66 
 
 		 776 aa  596  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  43.28 
 
 		 805 aa  592  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  41.69 
 
 		 792 aa  594  1e-168  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  43.83 
 
 		 840 aa  592  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  41.85 
 
 		 800 aa  585  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  41.86 
 
 		 817 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  41.18 
 
 		 867 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  42.97 
 
 		 788 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  41.69 
 
 		 793 aa  582  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  41.88 
 
 		 807 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  42.78 
 
 		 804 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  41.88 
 
 		 806 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  41.88 
 
 		 806 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  41.49 
 
 		 814 aa  581  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  42.15 
 
 		 805 aa  580  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  41.33 
 
 		 812 aa  579  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  41.69 
 
 		 815 aa  581  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  41.74 
 
 		 810 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  42.36 
 
 		 819 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  42.5 
 
 		 813 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  41.34 
 
 		 808 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  41.93 
 
 		 823 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  41.79 
 
 		 805 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  41.81 
 
 		 812 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  39.53 
 
 		 797 aa  578  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  40.53 
 
 		 810 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  41.47 
 
 		 807 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  41.63 
 
 		 807 aa  578  1.0000000000000001e-163  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  41.17 
 
 		 805 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  40.99 
 
 		 807 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  41.44 
 
 		 804 aa  576  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  40.83 
 
 		 794 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  41.04 
 
 		 805 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.28 
 
 		 784 aa  575  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  41.12 
 
 		 812 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  40.28 
 
 		 797 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  41.87 
 
 		 808 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  40.56 
 
 		 816 aa  575  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  42.22 
 
 		 793 aa  575  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  41.12 
 
 		 806 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  42.3 
 
 		 802 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  42.93 
 
 		 806 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  40.7 
 
 		 794 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  42.67 
 
 		 797 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  41.94 
 
 		 812 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  42 
 
 		 807 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  41.51 
 
 		 806 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  41.55 
 
 		 772 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  42.25 
 
 		 771 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.28 
 
 		 784 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  41.31 
 
 		 817 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  40.16 
 
 		 776 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.15 
 
 		 784 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  40.16 
 
 		 776 aa  570  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  40.16 
 
 		 776 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.42 
 
 		 784 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  41.49 
 
 		 812 aa  569  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.42 
 
 		 784 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  42.43 
 
 		 823 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.42 
 
 		 784 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.42 
 
 		 784 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.42 
 
 		 784 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  41.56 
 
 		 804 aa  569  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  41.79 
 
 		 837 aa  570  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.28 
 
 		 784 aa  572  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>