More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1548 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  56.78 
 
 		 812 aa  934    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  48.48 
 
 		 819 aa  762    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  60.26 
 
 		 805 aa  974    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  52.45 
 
 		 936 aa  681    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  45.56 
 
 		 791 aa  667    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  58.76 
 
 		 805 aa  977    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  44.37 
 
 		 817 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  58.79 
 
 		 805 aa  978    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  63.99 
 
 		 797 aa  1038    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  53.11 
 
 		 800 aa  856    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  57.46 
 
 		 807 aa  975    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  43.74 
 
 		 792 aa  642    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  54.11 
 
 		 814 aa  872    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  53.56 
 
 		 800 aa  855    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  58.54 
 
 		 808 aa  978    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 853 aa  1760    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  52.45 
 
 		 936 aa  681    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  57.97 
 
 		 800 aa  983    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  47.2 
 
 		 825 aa  709    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  58.94 
 
 		 805 aa  981    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  60.27 
 
 		 799 aa  996    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  60.61 
 
 		 798 aa  987    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  60.13 
 
 		 815 aa  991    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  60.52 
 
 		 799 aa  995    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  59.2 
 
 		 816 aa  993    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  56.31 
 
 		 809 aa  902    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  58.94 
 
 		 805 aa  974    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  44.83 
 
 		 882 aa  659    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  45.18 
 
 		 1104 aa  627  1e-178  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  42.01 
 
 		 810 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  42.63 
 
 		 806 aa  620  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  42.91 
 
 		 802 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  42.55 
 
 		 806 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  42.44 
 
 		 800 aa  612  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  43.13 
 
 		 828 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  44.04 
 
 		 778 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  42.27 
 
 		 807 aa  613  9.999999999999999e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  42.91 
 
 		 817 aa  613  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  41.32 
 
 		 816 aa  609  1e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  43.1 
 
 		 807 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  42.04 
 
 		 840 aa  610  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  41.4 
 
 		 797 aa  611  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  42.39 
 
 		 802 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  42.61 
 
 		 807 aa  611  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  42.03 
 
 		 806 aa  611  1e-173  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  41.74 
 
 		 814 aa  612  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  40.5 
 
 		 880 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  42.35 
 
 		 806 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  42.78 
 
 		 807 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  42.52 
 
 		 802 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  41.68 
 
 		 812 aa  606  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  43.8 
 
 		 775 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  42.54 
 
 		 808 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  42.78 
 
 		 806 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  42.35 
 
 		 806 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  41.41 
 
 		 805 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  42 
 
 		 808 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  41.85 
 
 		 810 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  41.87 
 
 		 812 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  41.17 
 
 		 788 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  41.74 
 
 		 812 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  41.13 
 
 		 805 aa  605  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  41.72 
 
 		 802 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  41.28 
 
 		 805 aa  602  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  41.62 
 
 		 856 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  41.14 
 
 		 867 aa  602  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  42.53 
 
 		 811 aa  599  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  41.51 
 
 		 813 aa  599  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  42.99 
 
 		 843 aa  602  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  40.39 
 
 		 797 aa  599  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  41.5 
 
 		 898 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  42.04 
 
 		 812 aa  599  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  42.95 
 
 		 804 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 		 835 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  42.53 
 
 		 796 aa  598  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  41.73 
 
 		 812 aa  596  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  39.66 
 
 		 820 aa  598  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  40.85 
 
 		 815 aa  595  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  42.19 
 
 		 805 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  41.5 
 
 		 829 aa  598  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  40.41 
 
 		 817 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  41.49 
 
 		 823 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  42.04 
 
 		 802 aa  598  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  41.18 
 
 		 776 aa  596  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  41.45 
 
 		 805 aa  598  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  41.23 
 
 		 805 aa  598  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  42.52 
 
 		 806 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 		 835 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  41.6 
 
 		 804 aa  595  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  41.55 
 
 		 812 aa  594  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  41.61 
 
 		 810 aa  593  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  40.54 
 
 		 823 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  41.78 
 
 		 768 aa  594  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  42.28 
 
 		 797 aa  594  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  40.82 
 
 		 807 aa  593  1e-168  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  40.76 
 
 		 776 aa  593  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  41.18 
 
 		 776 aa  595  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  41.45 
 
 		 805 aa  593  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  40.5 
 
 		 773 aa  590  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  40.37 
 
 		 773 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>