More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3488 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  53.13 
 
 		 800 aa  838    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  49.2 
 
 		 819 aa  761    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  61.34 
 
 		 805 aa  1021    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  45.43 
 
 		 791 aa  662    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  63.92 
 
 		 800 aa  1033    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  61.83 
 
 		 805 aa  1026    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  61.77 
 
 		 805 aa  1020    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 812 aa  1652    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  63.88 
 
 		 799 aa  1026    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  61.64 
 
 		 805 aa  1017    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  61 
 
 		 797 aa  967    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  62.45 
 
 		 798 aa  1028    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  44.06 
 
 		 882 aa  645    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  62.24 
 
 		 807 aa  1032    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  52.73 
 
 		 814 aa  842    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  61.46 
 
 		 805 aa  1024    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  56.78 
 
 		 853 aa  927    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  45.53 
 
 		 936 aa  654    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  45.53 
 
 		 936 aa  654    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  62.08 
 
 		 815 aa  1030    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  52.39 
 
 		 800 aa  829    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  47.48 
 
 		 825 aa  687    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  64.01 
 
 		 799 aa  1027    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  55.03 
 
 		 809 aa  851    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  61.79 
 
 		 816 aa  1045    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  61.76 
 
 		 808 aa  1030    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  41.73 
 
 		 817 aa  616  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  45.84 
 
 		 1104 aa  611  1e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  42.8 
 
 		 778 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  43.84 
 
 		 792 aa  607  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  41.16 
 
 		 806 aa  592  1e-168  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  42.17 
 
 		 806 aa  594  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  43.74 
 
 		 840 aa  590  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  43 
 
 		 800 aa  592  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  44.2 
 
 		 828 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  42.61 
 
 		 768 aa  586  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  41.15 
 
 		 810 aa  588  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  41.97 
 
 		 776 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  42.58 
 
 		 880 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  41.84 
 
 		 773 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  41.84 
 
 		 776 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  41.84 
 
 		 776 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  41.97 
 
 		 776 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  42.04 
 
 		 776 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  41.75 
 
 		 776 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  41.84 
 
 		 776 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  42.05 
 
 		 797 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  41.71 
 
 		 776 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  42.03 
 
 		 808 aa  581  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  41.74 
 
 		 812 aa  580  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  41.71 
 
 		 773 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  41.32 
 
 		 773 aa  580  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  42.8 
 
 		 774 aa  581  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  43.26 
 
 		 775 aa  581  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  42.5 
 
 		 807 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  42.64 
 
 		 816 aa  582  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  41.71 
 
 		 776 aa  581  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  43.52 
 
 		 797 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3052  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.38 
 
 		 784 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000101207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  42.02 
 
 		 806 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.52 
 
 		 784 aa  575  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  41.52 
 
 		 802 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  43.98 
 
 		 835 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.25 
 
 		 784 aa  575  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  41.41 
 
 		 812 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  41.54 
 
 		 810 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  41.57 
 
 		 775 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  43.86 
 
 		 835 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  41.02 
 
 		 805 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  41.6 
 
 		 773 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  43.64 
 
 		 843 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  41.63 
 
 		 812 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  41.63 
 
 		 812 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  41.34 
 
 		 807 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  42.34 
 
 		 807 aa  575  1.0000000000000001e-162  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3232  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.25 
 
 		 784 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  39.92 
 
 		 817 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  41.68 
 
 		 805 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  40.91 
 
 		 785 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3262  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.66 
 
 		 793 aa  572  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  41.49 
 
 		 867 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  41.13 
 
 		 787 aa  572  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  40.67 
 
 		 815 aa  571  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  41.06 
 
 		 829 aa  569  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1050  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.1 
 
 		 793 aa  570  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.362366  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  41.68 
 
 		 805 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  41.28 
 
 		 805 aa  572  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.92 
 
 		 784 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  41.64 
 
 		 804 aa  572  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  41.58 
 
 		 807 aa  569  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  41.41 
 
 		 805 aa  572  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  41 
 
 		 784 aa  567  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  41 
 
 		 799 aa  567  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  41 
 
 		 784 aa  567  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  40.55 
 
 		 823 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  41.37 
 
 		 823 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.6 
 
 		 786 aa  567  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  40.79 
 
 		 784 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  41.55 
 
 		 806 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  39.66 
 
 		 823 aa  568  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>