More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0670 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  45.62 
 
 		 805 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  42.02 
 
 		 788 aa  640    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  43.21 
 
 		 817 aa  649    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  47.13 
 
 		 819 aa  691    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  43.19 
 
 		 805 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  41.78 
 
 		 811 aa  659    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  44.78 
 
 		 773 aa  676    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  45.62 
 
 		 805 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  43.12 
 
 		 802 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 791 aa  1602    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  44.05 
 
 		 805 aa  703    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  44.34 
 
 		 806 aa  657    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  44.65 
 
 		 773 aa  679    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  43.19 
 
 		 805 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  46.71 
 
 		 773 aa  692    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  42.76 
 
 		 807 aa  641    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  45.36 
 
 		 798 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  44.81 
 
 		 805 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  44.78 
 
 		 776 aa  681    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.78 
 
 		 776 aa  681    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.91 
 
 		 776 aa  683    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  44.09 
 
 		 804 aa  657    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  43.95 
 
 		 774 aa  664    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  43.78 
 
 		 800 aa  639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  44.03 
 
 		 810 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  45.07 
 
 		 805 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  44.91 
 
 		 776 aa  682    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  43.96 
 
 		 803 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  46.61 
 
 		 797 aa  675    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  43.98 
 
 		 808 aa  649    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  45.04 
 
 		 776 aa  681    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  54.57 
 
 		 825 aa  837    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  43.13 
 
 		 840 aa  640    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  45.2 
 
 		 807 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  43.38 
 
 		 802 aa  649    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  44.85 
 
 		 797 aa  669    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  46.94 
 
 		 814 aa  736    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  42.78 
 
 		 808 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  46.46 
 
 		 816 aa  684    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  43.32 
 
 		 806 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  42.4 
 
 		 805 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  44.01 
 
 		 797 aa  671    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  44.66 
 
 		 813 aa  669    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  45.56 
 
 		 853 aa  649    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  44.78 
 
 		 773 aa  681    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  43.55 
 
 		 803 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  43.47 
 
 		 806 aa  648    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  43.88 
 
 		 768 aa  647    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  44.52 
 
 		 806 aa  669    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  43.59 
 
 		 812 aa  645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  43.25 
 
 		 802 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  44.91 
 
 		 776 aa  683    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  42.38 
 
 		 812 aa  643    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  44.81 
 
 		 792 aa  697    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  43.52 
 
 		 811 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  43.59 
 
 		 806 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  44.06 
 
 		 807 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  44.35 
 
 		 778 aa  649    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  43.72 
 
 		 812 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  45.49 
 
 		 805 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  45.27 
 
 		 815 aa  671    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  43.85 
 
 		 807 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  44.09 
 
 		 803 aa  643    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  50 
 
 		 806 aa  768    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  43.02 
 
 		 785 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  44.13 
 
 		 814 aa  656    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  45.18 
 
 		 810 aa  686    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  45.04 
 
 		 776 aa  679    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  42.99 
 
 		 804 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  43.17 
 
 		 805 aa  642    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  42.54 
 
 		 805 aa  639    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  43.32 
 
 		 806 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  45.45 
 
 		 799 aa  656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  43.19 
 
 		 867 aa  641    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  43.76 
 
 		 805 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  45.71 
 
 		 808 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  44.16 
 
 		 798 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  45.43 
 
 		 812 aa  651    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  44.09 
 
 		 804 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  45 
 
 		 800 aa  646    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  43.92 
 
 		 812 aa  645    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  44.26 
 
 		 775 aa  666    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  43.06 
 
 		 807 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  43.77 
 
 		 798 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  45.45 
 
 		 799 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  44.75 
 
 		 815 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  44.47 
 
 		 815 aa  659    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  46.9 
 
 		 809 aa  680    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  43.72 
 
 		 807 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  44.47 
 
 		 837 aa  665    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  47.63 
 
 		 800 aa  741    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  43.93 
 
 		 828 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  47.33 
 
 		 800 aa  743    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  42.8 
 
 		 806 aa  633  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  43.8 
 
 		 807 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  42.56 
 
 		 823 aa  632  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  42.99 
 
 		 815 aa  632  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  42.6 
 
 		 812 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  43.09 
 
 		 816 aa  634  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  43.06 
 
 		 823 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>