More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1019 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  43.28 
 
 		 1104 aa  681    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  45.61 
 
 		 806 aa  641    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  52.68 
 
 		 819 aa  834    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  53.49 
 
 		 799 aa  848    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 800 aa  1628    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  44.49 
 
 		 819 aa  641    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  53.32 
 
 		 805 aa  827    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  53.44 
 
 		 798 aa  844    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  47.33 
 
 		 791 aa  743    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  45.69 
 
 		 800 aa  668    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  44.09 
 
 		 816 aa  643    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  44.33 
 
 		 806 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  42.91 
 
 		 773 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  44.47 
 
 		 804 aa  645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  45.16 
 
 		 856 aa  641    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  55.39 
 
 		 936 aa  723    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  52.97 
 
 		 805 aa  829    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  42.53 
 
 		 776 aa  636    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  42.65 
 
 		 776 aa  639    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  42.78 
 
 		 776 aa  641    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  43.97 
 
 		 817 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  43.9 
 
 		 825 aa  644    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  45.32 
 
 		 806 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  53.02 
 
 		 805 aa  828    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  52.84 
 
 		 805 aa  827    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  42.71 
 
 		 774 aa  636    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  42.78 
 
 		 776 aa  641    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  44.39 
 
 		 818 aa  645    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  56.56 
 
 		 797 aa  879    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  45.13 
 
 		 882 aa  724    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  45.08 
 
 		 808 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  44.47 
 
 		 804 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  45.19 
 
 		 802 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  52.9 
 
 		 805 aa  823    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  45.24 
 
 		 802 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  54.49 
 
 		 807 aa  843    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  45.36 
 
 		 802 aa  647    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  74.81 
 
 		 814 aa  1237    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  97.62 
 
 		 800 aa  1595    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  43.22 
 
 		 880 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  44.74 
 
 		 804 aa  635    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  44.17 
 
 		 797 aa  645    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  44.94 
 
 		 823 aa  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  44.36 
 
 		 805 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  45.41 
 
 		 898 aa  642    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  53.11 
 
 		 853 aa  832    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  42.53 
 
 		 773 aa  636    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  45.33 
 
 		 828 aa  652    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  44.24 
 
 		 803 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  45.17 
 
 		 792 aa  675    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  45.61 
 
 		 806 aa  641    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  45.61 
 
 		 812 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  44.74 
 
 		 805 aa  637    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  43.93 
 
 		 823 aa  636    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  43.11 
 
 		 810 aa  663    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  56.33 
 
 		 816 aa  879    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  45.21 
 
 		 823 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  44.65 
 
 		 805 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  49.45 
 
 		 825 aa  765    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  55.39 
 
 		 936 aa  723    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  46.01 
 
 		 807 aa  647    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  52.39 
 
 		 808 aa  818    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  45.61 
 
 		 812 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  53.01 
 
 		 815 aa  841    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  44.74 
 
 		 807 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  44.63 
 
 		 812 aa  652    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  45.05 
 
 		 867 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  44.66 
 
 		 814 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  44.49 
 
 		 775 aa  658    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  45.42 
 
 		 810 aa  642    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  44.66 
 
 		 807 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  43.2 
 
 		 806 aa  645    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  52.39 
 
 		 812 aa  816    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  45.78 
 
 		 840 aa  655    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  44.16 
 
 		 776 aa  657    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  44.03 
 
 		 776 aa  653    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  44.07 
 
 		 778 aa  658    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  43.64 
 
 		 815 aa  656    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  52.3 
 
 		 809 aa  825    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  45.37 
 
 		 817 aa  667    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  42.91 
 
 		 776 aa  642    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  46.01 
 
 		 808 aa  650    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  47.8 
 
 		 805 aa  707    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  42.97 
 
 		 820 aa  647    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  45.05 
 
 		 797 aa  662    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  53.74 
 
 		 799 aa  850    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  47.16 
 
 		 817 aa  698    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  44.85 
 
 		 813 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  52.6 
 
 		 800 aa  824    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  45.48 
 
 		 806 aa  634  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  44.36 
 
 		 806 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  43.7 
 
 		 780 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  45.61 
 
 		 805 aa  635  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  44.47 
 
 		 812 aa  634  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  42.4 
 
 		 776 aa  633  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  42.99 
 
 		 768 aa  633  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  44.88 
 
 		 843 aa  635  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  42.4 
 
 		 773 aa  635  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  44.76 
 
 		 835 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  42.53 
 
 		 776 aa  634  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>