More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1597 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 353 aa  696    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  50.43 
 
 		 381 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  47.14 
 
 		 386 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  47.28 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  47.41 
 
 		 340 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  46.79 
 
 		 345 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  46.79 
 
 		 342 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  46.79 
 
 		 342 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  44.09 
 
 		 337 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  44.83 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  43.82 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  41.81 
 
 		 348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  44.31 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.96 
 
 		 348 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  42.54 
 
 		 356 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  40.5 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  42.28 
 
 		 338 aa  229  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  42.07 
 
 		 347 aa  228  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  44.05 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  40.06 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  39.22 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  38.82 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.22 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  40.06 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.98 
 
 		 441 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.9 
 
 		 348 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  38.94 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  38.18 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  39.13 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  38.02 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.39 
 
 		 354 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  37.21 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  38.91 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  33.62 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.81 
 
 		 376 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  36.86 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  33.85 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  33.85 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  33.85 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  33.85 
 
 		 340 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  33.85 
 
 		 340 aa  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  33.85 
 
 		 340 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  33.46 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.2 
 
 		 341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  32.3 
 
 		 345 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  31.91 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  44.03 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.9 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.34 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  51.72 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.49 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  33.03 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  36.31 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.32 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  29.3 
 
 		 357 aa  99.8  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  35.94 
 
 		 343 aa  96.7  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  34.24 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  32.82 
 
 		 350 aa  89.4  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  30.19 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  32.98 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  36.96 
 
 		 791 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  35.87 
 
 		 791 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  39.13 
 
 		 798 aa  55.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  36.96 
 
 		 791 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  46.15 
 
 		 628 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  38.46 
 
 		 783 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  38.46 
 
 		 786 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0860  ATP-dependent protease La  39.24 
 
 		 807 aa  53.1  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  37.78 
 
 		 571 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  37.5 
 
 		 652 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  40.45 
 
 		 472 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  42.11 
 
 		 802 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0133  endopeptidase La  40 
 
 		 655 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126751  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  26.56 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  40.79 
 
 		 802 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  34.44 
 
 		 619 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  34.44 
 
 		 619 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  35.9 
 
 		 812 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  39.24 
 
 		 803 aa  50.4  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  41.33 
 
 		 504 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  39.24 
 
 		 813 aa  50.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  27.98 
 
 		 500 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  37.33 
 
 		 800 aa  50.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  35.87 
 
 		 805 aa  50.4  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  40.79 
 
 		 801 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  40 
 
 		 503 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  39.24 
 
 		 815 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  37.68 
 
 		 309 aa  49.7  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  32.98 
 
 		 451 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  40.51 
 
 		 835 aa  49.7  0.00007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  32.98 
 
 		 455 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  32.98 
 
 		 455 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  32.98 
 
 		 455 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  31.87 
 
 		 809 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  34.02 
 
 		 788 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  32.97 
 
 		 810 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  41.77 
 
 		 353 aa  49.7  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  28.28 
 
 		 650 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  38.96 
 
 		 511 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>