More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0939 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 		 386 aa  763    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  58.21 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  47.23 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  47.08 
 
 		 342 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  47.08 
 
 		 342 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  47.14 
 
 		 353 aa  297  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  47.09 
 
 		 359 aa  293  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  47.35 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  44.41 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  46.4 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  41.91 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.48 
 
 		 348 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  42.07 
 
 		 348 aa  252  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  43.07 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  43.21 
 
 		 355 aa  246  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  45.31 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  43.81 
 
 		 316 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  44.61 
 
 		 345 aa  236  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.71 
 
 		 356 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  37.07 
 
 		 347 aa  209  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  38.58 
 
 		 342 aa  209  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  44.14 
 
 		 348 aa  209  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  37.11 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  40.35 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  41.53 
 
 		 374 aa  206  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  38.57 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.82 
 
 		 441 aa  192  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.6 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  37.76 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  36.17 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  38.91 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  35.21 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  34.79 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  35.77 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  40 
 
 		 353 aa  182  8.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  36.62 
 
 		 376 aa  176  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  29.8 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  29.51 
 
 		 345 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  29.51 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  29.68 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.09 
 
 		 341 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  29.68 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.21 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  29.39 
 
 		 340 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  29.39 
 
 		 340 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  29.39 
 
 		 340 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  29.39 
 
 		 340 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.86 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.61 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  47.01 
 
 		 295 aa  113  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  47.41 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  27.64 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.01 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  27.83 
 
 		 343 aa  106  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.61 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  27.48 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  26.36 
 
 		 357 aa  100  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  32.06 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  27.78 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  28.65 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  33.56 
 
 		 802 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  29.88 
 
 		 772 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3020  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  36.63 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  34.71 
 
 		 802 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  33.64 
 
 		 805 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  30.28 
 
 		 788 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  37.62 
 
 		 802 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  39.36 
 
 		 812 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  38.61 
 
 		 802 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  38.61 
 
 		 802 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  32.73 
 
 		 805 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  41.38 
 
 		 806 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  41.38 
 
 		 806 aa  54.7  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1610  Lon-A peptidase  33.64 
 
 		 805 aa  53.5  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000614629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  35.42 
 
 		 790 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  37.63 
 
 		 805 aa  53.5  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23630  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  42.68 
 
 		 577 aa  52.8  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  38.3 
 
 		 787 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  34 
 
 		 806 aa  52.8  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 		 867 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  32.62 
 
 		 818 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  34.41 
 
 		 809 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  28.29 
 
 		 477 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  28.29 
 
 		 477 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  40.23 
 
 		 809 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  44.12 
 
 		 807 aa  52.4  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  40.23 
 
 		 808 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  40.23 
 
 		 804 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  31.91 
 
 		 808 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  39.08 
 
 		 816 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  34.78 
 
 		 570 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  41.38 
 
 		 809 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1725  ATP-dependent protease La  39.24 
 
 		 814 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000125978  decreased coverage  0.00323118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  36.04 
 
 		 807 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0469  ATP-dependent protease La  45.45 
 
 		 823 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  31.21 
 
 		 806 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1556  ATP-dependent protease La  37.93 
 
 		 813 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  34.55 
 
 		 799 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  32.28 
 
 		 812 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  34.78 
 
 		 570 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>