More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1813 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1813  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 		 359 aa  725    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0366136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4655  PDZ/DHR/GLGF  87.06 
 
 		 340 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1414  PDZ/DHR/GLGF  73.62 
 
 		 345 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1432  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  73.68 
 
 		 342 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1468  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  73.68 
 
 		 342 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13214  hypothetical protein  67.65 
 
 		 340 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.303066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4111  hypothetical protein  46.76 
 
 		 337 aa  301  8.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07640  predicted secreted protein containing a PDZ domain protein  46.04 
 
 		 381 aa  299  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.574561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1597  PDZ/DHR/GLGF domain protein  47.28 
 
 		 353 aa  299  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.235489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0939  PDZ/DHR/GLGF domain protein  47.09 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3730  hypothetical protein  46.18 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3039  hypothetical protein  45.59 
 
 		 338 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3489  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  47.72 
 
 		 355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3727  peptidase S16 lon domain protein  43.68 
 
 		 350 aa  255  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.551436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8344  hypothetical protein  40.63 
 
 		 348 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2953  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  41.38 
 
 		 348 aa  242  9e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330402  normal  0.278749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0943  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.54 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0475  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.34 
 
 		 394 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4223  hypothetical protein  41.95 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3783  PDZ/DHR/GLGF  40.18 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331008  normal  0.173325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7929  PDZ/DHR/GLGF domain protein  38.87 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4378  secreted protein containing a PDZ domain-like protein  39.2 
 
 		 355 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0539  PDZ domain-containing protein  35.61 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.08903  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27490  predicted secreted protein containing a PDZ domain  35.98 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3797  PDZ domain-containing protein  36.34 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2472  PDZ domain-containing protein  35.29 
 
 		 342 aa  186  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11460  predicted secreted protein containing a PDZ domain  34.95 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0905061  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2750  PDZ domain-containing protein  36 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.693898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0723  hypothetical protein  32.94 
 
 		 358 aa  178  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15020  predicted secreted protein containing a PDZ domain  36.39 
 
 		 353 aa  176  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.820333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1528  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.15 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.194466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2463  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.44 
 
 		 441 aa  172  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236943  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1191  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.46 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2889  PDZ domain-containing protein  33.43 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19080  predicted secreted protein containing a PDZ domain  34.25 
 
 		 374 aa  158  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0257465  normal  0.465103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0792  peptidase S16 lon domain protein  35.08 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.746273  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1352  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.76 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000773296  normal  0.189925 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4038  PDZ domain protein  30.17 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000075262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3972  PDZ domain-containing protein  29.89 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3838  PDZ domain-containing protein  29.89 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3685  ATP-dependent protease La  30.31 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4136  pdz domain-containing protein  29.89 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1212  PDZ domain protein  30.17 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000943409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4027  PDZ domain protein  30.17 
 
 		 345 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3668  ATP-dependent protease La  29.89 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000638518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3941  PDZ domain protein  29.89 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2629  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.61 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000743366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3753  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.43 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1875  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.97 
 
 		 339 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1003  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.56 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10180  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.11 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.434283  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0112  hypothetical protein  44.83 
 
 		 293 aa  99.4  9e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0447  PDZ domain family protein  42.74 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0480503 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2463  protease  31.19 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1612  protease  30.03 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1258  Lon-like protease  32.4 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.383395  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1590  Lon-like protease  34.5 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0001011  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0455  hypothetical protein  26.05 
 
 		 357 aa  90.5  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1176  Lon-like protease  25.42 
 
 		 336 aa  86.7  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000375702  hitchhiker  0.0000395779 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0642  PDZ domain-containing protein  32.14 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000440565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 788 aa  59.3  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1645  ATP-dependent protease LonB  35.09 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4369  Sigma 54 interacting domain protein  38.64 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  37.63 
 
 		 558 aa  56.6  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.59 
 
 		 628 aa  56.6  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  37.11 
 
 		 652 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  36.56 
 
 		 650 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1383  ATP-dependent protease LonB  33.33 
 
 		 570 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.447835  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  37.23 
 
 		 815 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2560  ATPase central domain-containing protein  35.96 
 
 		 571 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  35.23 
 
 		 802 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2534  putative ATP-dependent protease La  31.19 
 
 		 670 aa  53.1  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000500974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 		 799 aa  52.8  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3302  endopeptidase La  32.97 
 
 		 648 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.468611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  35.23 
 
 		 802 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  35.11 
 
 		 810 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  34.48 
 
 		 793 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  42.42 
 
 		 801 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  40.58 
 
 		 632 aa  51.2  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.61 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  34.41 
 
 		 783 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3354  Sigma 54 interacting domain protein  36.36 
 
 		 575 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.398468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1654  endopeptidase La  33.62 
 
 		 566 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  37.63 
 
 		 818 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0864  peptidase M50  28.24 
 
 		 380 aa  50.1  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  35.48 
 
 		 796 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  34.41 
 
 		 786 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  38.64 
 
 		 815 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  34.02 
 
 		 809 aa  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  34.83 
 
 		 792 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  42.42 
 
 		 772 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1146  ATP-dependent protease La  39 
 
 		 801 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 789 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23310  Sporulation protease LonC  35.48 
 
 		 639 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  40.91 
 
 		 774 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  42.42 
 
 		 774 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  34.04 
 
 		 819 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  43.94 
 
 		 776 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  43.94 
 
 		 776 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  34.29 
 
 		 816 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>